Вперше в Україні здійснено порівняльну оцінку діагностичної ефективності молекулярно-генетичних методів видової диференціації мікобактерій і молекулярної епізоотології (ПЛР, рестрикційно-ензимного аналізу ділянки гена groEL2 (РЕА-hsp65), споліготайпінга, гель-електрофорезу в пульсуючому полі (ГЕПП), секвенування гіперваріабельної ділянки гена 16S pРНК. За допомогою молекулярно-генетичних методів визначено видову належність 125-ти штамів мікобактерій. Вперше одержано дані щодо циркуляції на території України таких видів мікобактерій, як Mycobacterium caprae, M. frederiksbergense, M. engbackii, M. doricum, M. parascrofulaceum, M. hassiacum, M. confluentis, M. elephantis. Виявлено, що найбільш поширеними зі 125-ти досліджених культур є M. avium complex, M. fortuitum, M. phlei. Вперше проведено типування штамів M.avium до підвидів M. avium subsp., hominissuis і M. avium subsp. avium. Серед досліджених 68-ми ізолятів атипових мікобактрій, виділених від великої рогатої худоби, 32 % віднесено до комплексу M. avium (зокрема, до M. avium subsp. hominissuis - 22,7 %); 17,3 % - до M.fortuitum; 9,3 % - до M. nonchromogenicum; 8 % - до M.phlei; 33,3 % - до інших 9-и видів атипових мікобактерій. Побудовано філогенетичне дерево, що відображає еволюційні взаємозв'язки 17-ти видів мікобактерій. За результами аналізу генетичної спорідненості мікобактерій підтверджено генетичну детермінацію їх розподілу на швидко- та повільнозростаючі. Виявлено, що класифікація мікобактерій за Раньйоном (1967 р.) не відображає філогенетичні взаємозв'язки мікобактерій. Розроблено ефективний метод виділення мікобактеріальної ДНК з бактеріальної маси для її використання в ПЛР. Створено систему видової диференціації мікобактерій і визначення їх генетичної спорідненості за допомогою генотипування. Розроблено родоспецифічну тест-систему для детекції бактерій роду за допомогою ПЛР.

  Скачати повний текст