В самом общем виде гипогенный спелеогенез определяется как формирование карстовых полостей под воздействием агентов, происходящих из глубины, в отличие от эпигенного спелеогенеза, в котором полостеформирующие агенты (метеорное питание и агрессивность вод) происходят с поверхности. Более конкретное определение должно основываться на признаках агентов и механизмов полостеобразования, позволяющих наиболее четко различать эпигенное и гипогенное происхождение полостей. Указание на "неповерхностное" происхождение источника агрессивности в таком различении (геохимический подход) является правомерным, но методически и практически неэффективным подходом. Гидрогеологический подход и использование критерия восходящего водообмена в определении гипогенного спелеогенеза образуют теоретически и методологически обоснованную основу не только для его идентификации, но и пространственно-временного прогнозирования.