Обгрунтовано підхід до інформатизації менеджменту наукових досліджень, згідно з яким інформаційна система є засобом здійснення інформатизації в науковій установі через створення корпоративного середовища документального супроводження наукових досліджень. Подано особливості побудови інформаційних систем на основі веб-технологій. Розроблено методологію інформатизації менеджменту наукової діяльності установ Національної академії педагогічних наук України, яка грунтується на сучасних підходах і методах побудови веб-систем. Описано модель типового сайту наукової установи як базового складника Інтернет-середовища Національної академії педагогічних наук України. Наведено методологію побудови, проектні рішення, методику використання та організаційно-педагогічні засади впровадження інформаційної системи менеджменту наукових досліджень.