Досліджено особливості функціонування державного вищого навчального закладу (ВНЗ) за ринкових умов. Класифіковано джерела фінансування ВНЗ і досліджено тенденцію збільшення грошових надходжень за рахунок позабюджетного фінансування. Підкреслено нерівномірне надходження грошових коштів на розрахунковий рахунок ВНЗ, що спричиняє підвищення навантаження на служби, які реалізують функції планування, обліку і контролю його фінансово-господарської діяльності. Обгрунтовано необхідність побудови гнучкої системи управління фінансово-господарської діяльності ВНЗ і створення системи контролінгу. Запропоновано концепцію синтезу механізмів управління ВНЗ, на основі якої розроблено концептуальну модель організації системи фінансового менеджменту. Розроблено моделі механізмів стратегічного управління, модель оперативного управління платіжною політикою, організації функціонування інформаційно-обчислювальної системи підтримки рішень у фінансовому менеджменті ВНЗ.