Наведено положення з питань створення теоретичних основ щодо підготовки та обгрунтування рішень у системі управління морськими перевезеннями вантажів і роботою флоту судноплавної компанії. Зазначено, що вони базуються на побудові діалогових систем прийняття рішень, оснащених пакетом розроблених або відомих моделей та методів, підібраних за принципом близькості до предметних задач, для розв'язання яких призначена система. Встановлено особливості перевізного процесу та системи управління на морському транспорті. Запропоновано концепцію системи управління морськими перевезеннями вантажів і роботою флоту судноплавної компанії. Розроблено та досліджено комплекс моделей та методів формування завантаження суден, а також підтримки рішень за різних рівнів вірогідності вхідної інформації. Наведено основні положення методичного забезпечення системи та запропоновано імітаційно-ігрову модель прийняття рішень у системі управління перевезеннями та роботою флоту морської судноплавної компанії.