Раскрыта сущность основных понятий и представлений теории ферментативных процессов. Описаны механизмы ферментативного катализа, приведены примеры биокаталитических реакций. Предложена классификация ферментов, охарактеризованы принципы пространственной организации молекул фермента.

С использованием математического аппарата теории сервисных систем описаны теоретические модели субстратзависимого роста гидробионтов (на примере микроорганизмов). Отмечено, что данные модели основаны на простых представлениях о механизме биологических реакций и включают специфические параметры, отражающие организацию "узкого места" метаболизма. Раскрыты возможности применения данных моделей для оценки организации систем метаболизма по форме экспериментальных кинетических кривых субстратзависимых реакций.

Рассмотрены вопросы кинетики ферментативных реакций. Описаны биофизические и биохимические механизмы ферментативных процессов в живой клетке и методы контроля и управления скоростью протекания и специфичностью биокаталитических процессов. Раскрыто содержание основных понятий энзимологии, химического катализа, в частности, аллостерических ферментов, стационарной кинетики Михаэлиса - Ментена, каталитической реакции с одним промежуточным соединением. Обоснована необходимость гипотезы о стационарности, предложены методы непрерывного потока, остановленной струи, метод Диксона, релаксационные методы, Описано приближение Лайнуивера - Берка.

Для получения новой информации о каталитических свойствах фермента, адсорбированного на поверхности липидных везикул, проведен кинетический анализ процесса окисления глюкозы глюкозооксидазой. За ходом ферментативной реакции наблюдали спектрофотометрически, применив pH-индикатор - нейтральный красный. Нейтральные, положительно или отрицательно заряженные липосомы изготовлены из яичного фосфатидилхолина или его смесей с цетилтриметиламмония бромидом (5 мол %) или кардиолипином (5 мол %). Найдена кажущаяся константа диссоциации нейтрального красного в этих системах в присутствии глюкозооксидазы. Ассоциация фермента с липосомами не вызвала изменения кинетических параметров взаимодействия глюкозооксидазы с глюкозой и кислородом.

Освещены теоретические основы молекулярной биофизики и ферментативного катализа. Раскрыты механизмы образования и функционирования биогенных компонентов клетки на атомно-молекулярном уровне, а также механизмы ферментативных процессов, методы контроля и управления скоростью протекания и специфичностью биокаталитических процессов. Дана информация о физических взаимодействиях в биомолекулах, гидрофобном эффекте, классификации аминокислот, фолдинге белка, строении нуклеотидов и липидов, углеводах, межмолекулярных взаимодействиях в биомембранах. Уделено внимание вопросам кинетики ферментативных реакций.

Розглянуто питання інтегрування метаболічних процесів у клітині на рівні ферментів. Розкрито особливості регулювання активності ферментів на різних рівнях клітинної організації. Наведено інформацію про олігомерні білки з регуляторними властивостями, поліфункціональні ферменти, протомери, особливості кінетичної поведінки алостеричних ферментів. Увагу приділено ковалентній модифікації ферментів, що забезпечує функціональну адаптацію окремих молекул або ферментних систем. Висвітлено значення функціонування мультиензимних комплексів в інтеграторних процесах. Показано роль мембранних структур у здійсненні компартменталізації метаболічних процесів і в їх інтегруванні.

Рассмотрены вопросы интегрирования метаболических процессов в клетке на уровне ферментов. Раскрыты особенности регулирования активности ферментов на разных уровнях клеточной организации. Дана информация об олигомерных белках с регуляторными свойствами, полифункциональных ферментах, протомерах, особенностям кинетического поведения аллостерических ферментов. Уделено внимание ковалентной модификации ферментов, обеспечивающей функциональную адаптацию отдельных молекул или ферментных систем. Освещено значение мультиэнзимных комплексов в интегративных процессах. Показана роль мембранных структур в осуществлении компартментализации метаболических процессов и в их интегрировании.

Изложены основные представления о качественных и количественных характеристиках реакционной способности органических соединений, механизмах реакций замещения у насыщенных и ненасыщенных реакционных центров, структуре переходного состояния и промежуточных продуктов реакции, типах и механизмах каталитических реакций, знание которых является ключевым для понимания природы каталитического действия ферментов.

Освещены теоретические основы биокатализа, специфика биокатализаторов, особенности энергетики биохимических реакций. Приведены классификации ферментов (оксидоредуктазы, трансферазы, гидролазы, лиазы, изомеразы, лигазы) и аминокислот (специальные, неполярные и ароматические, полярные незаряженные, заряженные). Определены строение белков, физические взаимодействия в ферментах, механизмы ферментативных процессов и кинетика ферментативных реакций (ФР). Внимание уделено стационарной кинетике Михаэлиса-Ментен, регуляции скоростей ФР и ФР в нестационарном режиме.

Розглянуто сучасні методи дослідження активності ферментів та методи визначення вмісту окремих метаболітів і конферментів з використанням різних типів ензимів. Визначено активність лактатдегідрогенази, каталази, сумарну NO-синтазну активність, церулоплазміну у плазмі крові, ізоферментний спектр лактатдегідрогенази в гомогенатах та цитоплазматичній фракції тканин. Описано ферментативний метод визначення глюкози в біологічних рідинах і тканинах.

Рассмотрены современные методы исследования активности ферментов и методы определения содержания отдельных метаболитов и конферментов с использованием разных типов энзимов. Определены активность лактатдегидрогеназы, каталазы, суммарная NO-синтазная активность, церулоплазмина в плазме крови, изоферментный спектр лактатдегидрогеназы в гомогенатах и цитоплазматической фракции тканей. Описан ферментативный метод определения глюкозы в биологических жидкостях и тканях.

Досліджено задачу про взаємодію препарату (ферменту), що постачається тканині, з його структурою (субстратом). Під час розв'язування задачі не введено обмеження на малість величини ферменту, що приймалось раніше. В цьому разі на відміну від попередніх досліджень знято обмеження на малість підведеного ферменту. Побудовано аналітичні розв'язки відповідної задачі Коші за допомогою методу степеневих рядів і числові розв'язки з використанням методу Рунге - Кутта - Фельберга. Наведено аналітичні та числові результати, що характеризують зміну концентрації субстрату та фермент-субстратного комплексу зі зростанням часу.

За допомогою адсорбції або фільтрування розчину протеази крізь ультрафільтраційні C010 і P010 мембрани одержано біокаталітичні мембрани з іммобілізованим ферментом. Показано, що такі мембрани характеризуються значно вищою продуктивністю у процесі ультрафільтрації молочної сироватки у порівнянні з вихідними мембранами завдяки здатності іммобілізованого ферменту розщеплювати білкові молекули, які акумулюються на поверхні мембрани та спричиняють її забруднення. Досліджено вплив кількості іммобілізованого ферменту, його зшивання глютаровим диальдегідом, температури сироватки на роботу біокаталітичних мембран.

Індекс рубрикатора НБУВ: Г297.31-2 + Е0*725.111.4*042

Рубрики:

Ферменти

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж72108 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.4*041 + Е60*669.51-64

Рубрики:

Загальна біологія

Загальна зоологія

Шифр НБУВ: Ж61875 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*444*721 + Е0*725.111.4*046

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Щоб посилити ефективність впливу монофункціональних алкілуючих протипухлинних препаратів, важливим є зниження активності системи ексцизійної репарації основ (ЕРО), яка виправляє значну частину пошкоджень ДНК, що виникають за дії цих препаратів. Мета роботи - створення інгібіторів і ключових ферментів ЕРО (ПАРП1, ПАРП2, пол beta, АРЕ1) за рахунок направленої модифікації гліциретової кислоти (ГК). Аміди ГК одержано з ацетату ГК через утворення відповідного ацилхлориду, амідування відповідним аміном з наступним деацилюванням. Невелику бібліотеку 2-ціанозаміщених метилових ефірів ГК одержано структурною модифікацією остова ГК і карбоксильної групи. Інгібуючу активність сполук оцінено у відповідних специфічних тестах за присутності або відсутності сполук. Жодна з протестованих сполук не інгібує ПАРП1 значною мірою. Немодифікована ГК та її морфоліновий амід виявилися м'якими інгібіторами ПАРП2. Похідні ГК, які містять кето-групу в 11-му положенні тритерпенового остова, проявили помірні інгібуючі властивості стосовно пол beta. Сполука 3, яка вміщує 12-оксо-9(11)-єновий залишок у кільці C, - єдина серед усіх вивчених сполук інгібує АРЕ1. Знайдено клас сполук, селективно інгібуючих ДНК-полімеразу beta. Виявлено селективний інгібітор АРЕ1 і м'який інгібітор ПАРП2.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.4*04 + Л662.23/28-3

Рубрики:

Загальна біологія

Синтетичні лікарські речовини та препарати

Шифр НБУВ: Ж100178 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Розглянуто інгібітори цистеїнових протеїназ (ЦП), які відомі своїм важливим значенням для багатьох біохімічних процесів, які відбуваються в живому організмі. Вони також беруть участь у виникненні та розвитку значної кількості захворювань, спричинених, серед іншого, анормальним білковим кругообігом. Одним із головних регуляторів активності зазначених протеїназ є їх специфічні інгібітори - цистатіни. Висвітлено сучасні уявлення щодо ендогенних інгібіторів лізосомних ЦП та їх синтетичних аналогів.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.4*041

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Зазначено, що 6-фосфофрукто-2-кіназа/фруктозо-2,6-бісфосфатаза є одним із ключових ензимів регуляції метаболізму глюкози, оскільки цей біфункціональний ензим контролює не лише гліколіз і глюконеогенез, а й значною мірою метаболізм глюкози, зокрема її фосфорилювання. 6-фосфофрукто-2-кіназа/фруктозо-2,6-бісфосфатаза-2 (PFKFB-2) відіграє важливу роль у регуляції гліколізу не лише у міокарді, а і в деяких інших органах (нирці, головному мозку та легені). У результаті досліджень у клітинах гліоми людей і в різних органах миші виявлено ряд нових унікальних альтернативних сплайс-варіантів мРНК PFKFB-2, що утворюються в результаті делецій або/і вставок як у каталітичних ділянках 6-фосфофрукто-2-кінази та фруктозо-2,6-бісфосфатази, так і в C-кінцевій регуляторній зоні. Альтернативні сплайс-варіанти мРНК PFKFB-2 із клітин гліоми та миші містили різної довжини вставки після 2-го екзону, але сплайс-варіант миші мав ще делецію у 6-фосфофрукто-2-кіназній ділянці та вставку на C-кінці. Інші сплайс-варіанти миші мали делеції у 6-фосфофрукто-2-кіназній або фруктозо-2,6-бісфосфатазній ділянках, а один із сплайс-варіантів мав делецію всіх каталітичних доменів. Одержані результати свідчать про важливу роль альтернативного сплайсингу в регуляції гліколізу шляхом утворення різних монофункціональних ізоформ ензиму.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.4*041

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ