Досліджено вплив кремнієвмісної суміші (КВС) на алелопатичні та мікробіологічні характеристики прикореневого середовища рослин лимону (Citrus limon (L.) Burm.) з метою збереження генофонду цінних інтродуцентів. КВС вносили у грунт під багаторічні насадження Citrus limon сорту Genoa колекції цитрусових рослин Національного ботанічного саду ім. М. М. Гришка НАН України за умов оранжерейної культури. Виявлено позитивний вплив КВС на грунтову мікробіоту лимонарію. Застосування КВС призводило до зростання кількості досліджуваних еколого-трофічних груп мікроорганізмів, крім мікроміцетів, у грунті під рослинами Citrus limon в усі терміни спостережень. Інтенсифікація трансформації органічної речовини сприяла зменшенню темпів акумуляції рухливих форм фенольних сполук, що виконують алелопатичну функцію та можуть знижувати продуктивність рослин, у прикореневому середовищі Citrus limon. Використання кремнієвмісної суміші оптимізувало окисно-відновний режим і алелопатичний стан прикореневого грунту багаторічних насаджень Citrus limon. Ефективність застосування КВС, загалом, підвищувалася зі збільшенням терміну після її внесення.