Международный проект "Протеом человека" (ППЧ), являющийся логическим продолжением проекта "Геном человека", начат 23 сентября 2010 года. В соответствии с геноцентрическим подходом целью ППЧ является подготовка каталога всех протеинов человека и расшифровка сети их взаимодействий. Трудности реализации ППЧ возникают вследствие того, что сам объект исследования - протеом - гораздо сложнее генома. Основной проблемой является недостаточная чувствительность протеомных методов, не позволяющая детектировать низко- и ультранизкокопийные протеины. Плохая воспроизводимость протеомных методов и отсутствие так называемого "золотого стандарта" является второй основной сложностью в реализации ППЧ. Третья проблема - это динамичный характер протеома, его нестабильность во времени. Рассмотрены возможные варианты преодоления этих сложностей, препятствующих успешному выполнению ППЧ.