Математично обгрунтовано концепцію субстратного протектування (СП) у ферментативному каталізі. Залежно від величини параметра протектування розраховано кінетичні залежності концентрації продукту хімічної реакції, які в цілому якісно відтворюють її фазу наростання, а далі вихід на стаціонарний режим (насичення). Одержані теоретичні результати можуть зацікавити як у процесі конкретного аналізу експериментів із СП у ферментативному каталізі, так і у процесі дослідження дії АТФ як протектора стосовно АТФ-азної активності міозину у разі м'язового скорочення.

Побудовано математичні моделі впливу деяких оборотних ефекторів на ферментативну і транспортну активність білків гладеньких м'язів. На підставі аналізу даної математичної моделі скорочення гладенького м'яза надано тлумачення впливу білка А золотистого стафілокока на процес скорочення-розслаблення. Запропоновано новий оптимізований математичний підхід щодо кінетичної характеристики дії оборотних ефекторів на ферментативну активність білків гладеньких м'язів. Досліджено числові значення коефіцієнтів модифікації кінетичних констант. Методами молекулярного моделювання відібрано 82 сполуки з властивостями специфічних інгібіторів АТФ-азної активності міозину.

Створення новітніх фармацевтичних препаратів для лікування хвороб, пов'язаних з порушеннями функціонування протеїнових комплексів, є важливою медико-соціальною проблемою, яка потребує комплексного підходу до її вирішення, зокрема врахування останніх досягнень в галузі комп'ютерного моделювання біологічних процесів. Узагальнено дані літератури щодо структури, функціонування, класифікації, молекулярних порушень доменів SH2 (Src Homology), а також надано характеристику методу молекулярного докінгу, як одного з найперспективніших методів фармакологічних досліджень. Показано, що найбільший інтерес з погляду практичного застосування для одержання нових патентоспроможних інгібіторів протеїн-протеїнових взаємодій методом молекулярного докінгу становлять саме SH2-домени, оскільки вони беруть активну участь у внутрішньоклітинній передачі сигналів, виступаючи як посередники цих специфічних взаємодій.

The influence of the medium pH on the myosin ATPase activity of smooth muscles has been investigated. The mathematical simulation which describes the ATP-hydrolase biochemical reaction with a change of the medium pH in a muscular fiber is carried out.

З використанням методів молекулярного моделювання знайдено сполуки, які мають високий рівень передбачуваної спорідненості до міозину і можуть бути конкурентними інгібіторами його АТФазної активності.

Зазначено, що біологічні процеси в живих системах відбуваються за участі великої кількості різноманітних білкових молекул, які функціонують завдяки взаємодії одна з одною у складі стабільних або динамічних білкових комплексів. Знання просторової структури комплексів клітинних білків і мембранних рецепторів із лігандами є важливим кроком на шляху до розуміння механізмів їх функціонування. Запропоновано алгоритм дослідження SH2-доменів на прикладі білка STAT3 із використанням методу докінгу міжмолекулярних взаємодій, який дозволяє передбачити конформацію ліганду всередині активного центра. Це, зокрема, відкриває шлях до раціонального пошуку та дизайну нових лікарських препаратів, що володіють протипухлинною активністю.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.4*04

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.3

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е60*738.821

Рубрики:

Загальна зоологія

Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ