Ключ. слова: полімеразна ланцюгова реакція, ПЛР, лістерія, множинне вирівнювання
Індекс рубрикатора НБУВ: Е422.266*44

Рубрики:

Listeria

Шифр НБУВ: Ж22205 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е40*725.112.1

Рубрики:

Загальна мікробіологія

Шифр НБУВ: Ж60216 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е521.20в733.7

Шифр НБУВ: Ж60216 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.112.1

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж60216 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Одержано зонди для атомно-силової мікроскопії (АСМ), функціоналізовані бичачим сироватковим альбуміном (БСА), які можна використовувати для вивчення процесів молекулярного пізнавання. Процедура модифікації та функціоналізації АСМ зонда включає три етапи. Спочатку шляхом модифікації в парах похідного аміносилану одержано амінозонд, з поверхневими аміногрупами якого взаємодіяв амінореакційний гомобіфункціональний лінкер. На заключному етапі зонд із ковалентно приєднаним лінкером був функціоналізований молекулами БСА. Одержані АСМ зонди охарактеризовано на різних етапах модифікації за допомогою АСМ у режимі силових вимірювань - із силових графіків визначено силу адгезії. Процес модифікації поверхні зонда підтверджено візуалізацією молекул БСА та суперспіральної ДНК pGEMEX, іммобілізованих на стандартній амінослюді та амінослюді, що модифікована лінкерним агентом.

Розроблено набір праймерів, який дає змогу за допомогою полімеразної ланцюгової реакції здійснювати ампліфікацію провірусної ДНК ретровірусу нез'ясованої патології - вірусу імунодефіциту великої рогатої худоби (ВІ ВРХ). Як мішень для праймерів вибрано короткий фрагмент гена pol ВІ ВРХ, для якого були відомі послідовності провірусної ДНК, виділений з культури клітин з ВІ ВРХ, а також із лімфоцитів експериментально інфікованих тварин. Обговорено проблему детекції ВІ ВРХ із клінічного матеріалу від експериментально чи природно інфікованих тварин. Амплікон очікуваного розміру детектовано для ДНК, екстрагованої з лімфоцитів периферійної крові серопозитивних овець і корів, що були експериментально інфіковані ВІ ВРХ.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.112.2в733

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж60216 Пошук видання у каталогах НБУВ 

  Скачати повний текст

Індекс рубрикатора НБУВ: Е40*440.224 + Р264.935.4-6

Рубрики:

Загальна мікробіологія

Паличка туберкульозу

Шифр НБУВ: Ж60216 Пошук видання у каталогах НБУВ 

На цей час відомо низку температурно-чутливих елементів - РНК-термометрів, що відрізняються структурно та функціонально, і які контролюють розмаїття біологічних процесів бактерій, включаючи вірулентність. Відомі PHК-термометри є структурами, що являють собою або одну протяжну шпилькову структуру, або декілька шпильок, які можуть бути як досконалими, так і недосконалими. На основі комп'ютерного та термодинамічного аналізів повністю секвенованих геномів 25 ізолятів Salmonella enteriса встановлено алгоритм та критерії пошуку потенційних РНК-термометрів, що дозволить в подальшому провести пошук потенційних РНК-термометрів в геномі інших соціально значимих патогенів. Для S. enterica на додаток до відомого 4U-PHК-термометра визначено чотири шпилькові структури, які можуть бути новими РНК-термометрами. Вони відповідають необхідним та достатнім умовам утворення РНК-термометрів та є висококонсервативними неканонічними структурами, оскільки присутні в геномі всіх досліджених ізолятів S. enterica. Проаналізовано температурно-чутливий мотив в плазміді рХО1 збудника сибірки Bacillus anthracis, а досконалі шпильки, що утворюють хрестоподібну структуру в суперспіральній плазміді pUC8, візуалізовано за допомогою атомно-силової мікроскопії.

Здійснено теоретичне й експериментальне порівняння чотирьох наборів праймерів для детекції провірусної ДНК вірусу лейкозу великої рогатої худоби (ВЛ ВРХ) за допомогою методу полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР). Продемонстровано, що використання праймерів із 100 %-м ступенем гомології для всіх відомих ізолятів ВЛ ВРХ дозволило виявити більшу кількість вірусоносіїв, ніж праймерів з меншим рівнем гомології, які мають по 2 - 4 помилкових (неспарених) нуклеотиди. Сформульовано основні положення програми з безвакцинного викорінення ВЛ ВРХ в Україні. Показано, що праймери з комерційного набору для ПЛР-детекції вірусу імунодефіциту людини 1-го типу мають 5 - 7 помилкових нуклеотидів, що може істотно знижувати якість ПЛР-діагностикуму.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е40*441.147в733.7

Рубрики:

Загальна мікробіологія

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

За допомогою атомно-силової мікроскопії візуалізовано комплекси РНК-полімерази (РНКП) бактеріофага T7 із ДНК-матрицею (яка містить промотор і термінатор транскрипції T7 РНКП) у процесі транскрипції. На рівні пар поодиноких молекул одержано зображення як неспецифічних (сформованих молекулою T7 РНКП із кінцевими фрагментами ДНК-матриці), так і специфічних (утворених T7 РНКП із промотором та областю термінації транскрипції) комплексів. Обговорено вплив параметрів транскрипції на комплексоутворювання.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.112.1

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.112.1

Рубрики:

Загальна біологія

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Р264.932 + Е422.251*441.147

Рубрики:

Bacillus

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е422.251*992.4*44 + Р264.932

Рубрики:

Bacillus

Шифр НБУВ: Ж100178 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Р264.92с21

Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ 

За допомогою атомно-силової мікроскопії візуалізовано комплекси, утворені у процесі транскрипції РНК-полімеразою бактеріофага Т7 (Т7 РНКП) з ДНК-матрицею, яка містить промотор та внутрішній термінатор. На рівні одиничних молекул одержано зображення стабільних специфічних комплексів, утворених Т7 РНКП з термінальним фрагментом ДНК-матриці, локалізованим на відстані близько 200 пар нуклеотидів від промотору. У процесі елімінації неспецифічного зв'язування візуалізовано одиничні молекули ДНК-матриці в комплексі з 2 - 3 молекулами Т7 РНКП. Візуалізовані комплекси ДНК - Т7 РНКП, в яких міститься 3 молекули білка на одній молекулі ДНК-матриці, відповідають етапам ініціації, елонгації та термінації транскрипції. Обговорено особливості утворення специфічних та неспецифічних комплексів ДНК - РНК під час ініціації та елонгації транскрипції.

Розроблено систему праймерів для мультиплексної полімеразної ланцюгової реакції з метою одночасного визначення статі передімплантаційних ембріонів і детекції вірусу лейкозу великої рогатої худоби у їх геномі, середовищі для культивування. Набори праймерів, апробовані на лімфоцитах крові ВРХ, дозволяють правильно визначити стать усіх досліджених тварин.