Індекс рубрикатора НБУВ: Е50*725.111.4*011

Рубрики:

Загальна ботаніка

Шифр НБУВ: Ж60216 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*55 с + Р281 с13

Рубрики:

Загальна біологія

Фармакологія

Шифр НБУВ: Ж25189 Пошук видання у каталогах НБУВ 

На підставі результатів хемогеномного аналізу тваринних та рослинних протеїнфосфатаз виконано кластеризацію за подібністю сайтів зв'язування ряду комерційно доступних інгібіторів. Встановлено рослинні протеїнфосфатази, які є найбільш вірогідними мішенями окадаїнової кислоти, мікроцистину, калікуліну, таутоміцину, нодуларину, мотупорину, кантаридину, кантаридинової кислоти та ендоталу.

In the framework of UNG virtual organization CSLab-Grid, high-throughput molecular screening was performed for new anti-TB compounds. Using program FlexX installedon IFBG Claster and models of four perspective ligand binding sites on the surface of FtsZ of Mycobacterium tuberculosis, virtual screening was erformed for database containing 2886 compounds synthesized in the Institute of Organic Chemistry of NAS of Ukraine. Based on LE and IG score, docking scores of CCDC Gold, and results of molecular dynamics, we selected a group of perspective FtsZ inhibitors. In vitro validation have revealed 6 compounds with the highest inhibition of GTPase activity of FtsZ. Also, based on in vitro experiment, we have selected three compounds exhibiting both - strong inhibition of FtsZ polymerization and inhibition of GTPase activity.

За допомогою методики секвенування ДНК нового покоління проаналізовано ДНК мікробіому субстрату у шести точках 4-го аварійного енергоблока ЧАЕС, в якому потужність дози на мікроорганізми коливається від 0,007 до 0,12 Гр/год. Установлено, що найбільш різноманітним і стабільним виявився мікробіом зразка, що був розташований за межами об'єкта "Укриття" на території проммайданчика (умовний контроль). У ньому відсутні домінанти, тобто він є найбільш збалансованим і наближеним за станом до мікробіому грунту екосистем, що оточують ЧАЕС. Для зразка, потужність обрахованої дози на місці відбору якого була найвищою, загальна кількість представлених видів була у 8 разів меншою, проте індекс домінування був найвищим, що свідчить про формування мікробіому з чітко вираженими домінантами.

Увагу присвячено дослідженню протеїн фосфатаз, задіяних в регуляції цитоскелету у рослин та вивченню особливостей їх взаємодії зі специфічними інгібіторами. У результаті проведених досліджень було реконструйовано повні фосфатоми рослин, які представлені суперродинами серин/треонін-, тирозин- та аспартат-специфічних протеїнфосфатаз. Відібрано групу рослинних протеїнфосфатаз, пов’язаних з регуляцією структури та функцій мікротрубочок, та реконструйовано тривимірні моделі протеїнфосфатаз людини і представників одно- та дводольних рослин. Встановлено структурно-біологічні особливості взаємодії інгібіторів з протеїнфосфатазами рослин. Зазначено, що оригінальні дані щодо сайтів ліганд-білкової взаємодії розширюють уявлення стосовно механізмів, що обумовлюють селективність відомих інгібіторів протеїнфосфатаз та особливостей їх дії в клітинах вищих рослин і мають значення для подальшого раціонального дизайну сполук з антифосфатазною активністю. Наголошено, що встановлені відмінності спорідненості інгібіторів до різних PP1, PP2A і PP4 рослин дають можливість оптимізувати молекулярний дизайн нових біологічно активних сполук із підвищеною селективністю до зазначених молекулярних мішеней. Висловлено припущення про 5 похідних інгібіторів протеїнфосфатаз з більшим рівнем спорідненості до цільових PP1, PP2A, PP4, які можуть знайти застосування як нові ефективні інгібітори протеїнфосфатаз вищих рослин.