Исследованы предпосылки создания системы управления финансовыми потоками с использованием современных концепций менеджмента. Приведены механизмы стратегического управления финансовыми и информационными потоками МОНМСУ, определяющие потребности отрасли в финансировании, и обеспечивающие распределение выделенных финансовых ресурсов подведомственным экономическим объектам. Охарактеризованы методы оперативного планирования и распределения бюджетных денежных средств между получателями, рассмотрены подходы к организации и рационализации процесса принятия их отчетной документации. Рассмотрены также подходы к созданию информационно-аналитической системы поддержки принятия решений на уровне МОНМСУ, слагаемыми которой являются виртуальные образования отдельных процессов.