Обгрунтовано теоретико-методичні засади державного управління (ДУ) діяльністю ВНЗ, розроблено практичні рекомендації щодо інноваційного розвитку його організаційного, фінансового й інформаційного механізмів. Досліджено концептуальні підходи до здійснення ДУ діяльністю ВНЗ за сучасних умов інноваційного розвитку держави. Розглянуто сутність і зміст чинних механізмів ДУ їх діяльністю, розкрито особливості реалізації таких механізмів відповідно до принципів Болонської декларації. Проаналізовано стан правового забезпечення механізмів ДУ діяльністю ВНЗ на сучасному етапі інноваційного розвитку держави. Досліджено тенденції формування організаційного механізму ДУ діяльністю ВНЗ у контексті оптимізації їх внутрішньої організаційно-управлінської структури згідно з принципами автономії, відповідальності та диверсифікації. Визначено стан дієвості фінансового механізму ДУ діяльністю ВНЗ з урахуванням внутрішніх можливостей і змін у зовнішньому середовищі. Розроблено стратегію формування та розвитку інноваційного ДУ діяльністю ВНЗ на основі інформаційно-інноваційних технологій та удосконалення інформаційного забезпечення реалізації фінансового механізму державного управління діяльністю ВНЗ.