Викладено класичні та сучасні методи і прийоми дослідження екології мікроорганізмів. Висвітлено загальні уявлення про основні складові екології біологічних систем. Обгрунтовано методи і принципи культивування мікроорганізмів різних еколого-трофічних груп. Детально розглянуто екофізіологічні, культуральні та фізіолого-біохімічні властивості мікроорганізмів, їх ідентифікації із природних ценозів без виділення в чисті культури. Розкрито особливості мікробіологічних процесів в екосистемах та їх прикладні аспекти.