На вибірці у 2 907-ми корів із 17-ти господарств трьох регіонів Нечорноземної зони Європейської частини Росії встановлено, що у холмогорської худоби синтез каппа-казеїну контролюється алельними генами <$E kappa - roman {Cn sup A}> та <$E kappa - roman {Cn sup B}>. Середня частота виникнення <$E kappa - roman {Cn sup A}> склала 0,689, <$E kappa - roman {Cn sup B}> - 0,311, в заводських стадах - 0,718 та 0,282, в репродуктивних - 0,714 та 0,286, в товарних - 0,629 та 0,371. Високу частоту алеля <$E kappa - roman {Cn sup B}> виявлено в субпопуляції холмогорської худоби Республіки Комі - 0,331. У стадах холмогорської худоби заплави р. Печори частота <$E kappa - roman {Cn sup B}> досягла значень 0,520 та 0,575. Зроблено припущення про селективне значення поліморфізму та необхідність раціонального використання генофонду вітчизняної худоби.