Сиквенированы нуклеотидные последовательности генов 16S рРНК термофильных метанокисляющих бактерий UCM B-3014, UCM B-3026, UCM B-3032, UCM B-3109, изолированных ранее из ила водоемов различных регионов Украины и депонированных в Украинской коллекции микроорганизмов (UCM) как Methylococcus thermophilus и "M. gracilis". Сравнительный анализ последовательностей генов 16S рРНК изучаемых бактерий с таковыми последовательностями различных видов бактерий в базе данных GenBank показал, что уровень сходства штаммов UCM B-3026, UCM B-3032, UCM B-3109 с Methylocaldum szegediense составил 98,0 - 98,7 %, штамма UCM B-3О14 с Methylocaldum gracile - 99,1 %, что позволило отнести их к этим видам. С другими видами рода Methylocaldum эти штаммы имели более низкий уровень сходства (94,8 - 97,2 %), а с M. thermophilus АСМ <$E 3585 sup roman Т> (= IMV-B-<$E 3037 sup roman Т> = UCM B-<$E 3037 sup roman T>) - менее 90 %. Таким образом, штаммы UCM B-3026, UCM B-3032, UCM B-3109 были реклассифицированы как M. szegediense, штамм UCM B-3014 - как M. gracile. При построении филогенетического дерева, основанного на сравнении генов 16S рРНК с использованием различных алгоритмов, реализованных в пакетах программ Tree View (версия 1.5.2) и ClastalX (версия 1.81), отдельные кластеры сформировали роды Methylocaldum, Methylococcus и Methylomonas. Роды Methylobacter и Methylomicrobium сформировали три кластера, при этом один из них содержал 2 вида Methylobacter и 2 вида Methylomicrobium. По-видимому, таксономия родов Methylobacter и Methylomicrobium нуждается в уточнении.

Ключ. слова: Methylocaldum, Methylococcus, ген 16S рРНК, идентификация, филогенетический анализ
Індекс рубрикатора НБУВ: Е422.144*725.112.23

Шифр НБУВ: Ж22205 Пошук видання у каталогах НБУВ 

---

Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
(cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)

• Рокитко Павло Васильович (біологічні науки)

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"