С помощью метода спектрофотометрии в видимой и УФ областях и численных методов расчета параметров связывания исследовано взаимодействие биологически активного нуклеозида 6-азацитидина (6AZC) с молекулами ДНК с различными структурными изменениями. Рассмотрены смеси 6AZC - ДНК и 6AZC - ДНК - бромистый этидий (ЭБ). Для каждой рассматриваемой модели взаимодействия оптимальные величины n, К и <$E epsilon> образующихся комплексов при связывании 6AZC с ДНК рассчитывались в программах оптимизации DALS, COMP и DALSMOD. Показано, что 6AZC не связывается с полностью денатурированной ДНК. При этом взаимодействует с нативной ДНК (<$Eroman {К~=~5~cdot~10 sup 2~М sup -1}>), частично денатурированной ДНК (<$E roman {К~=~2~cdot~10 sup 3~М sup -1}>) и ДНК в комплексе с ЭБ (<$E roman {К~=~1,3~cdot~10 sup 4~М sup -1}>). Наибольшая константа связывания 6AZC с ДНК получена для смеси 6AZC - ДНК - ЭБ. Показано, что не только 6AZC влияет на связывание ЭБ с ДНК, но существует и обратный эффект - в присутствии ЭБ 6AZC связывается с нативной ДНК с большей константой. Наиболее предпочтительным объяснением такого поведения при связывании 6AZC с ДНК может оказаться то, что вторичная структура ДНК была изменена вследствие интеркаляции ЭБ. Стехиометрия связывания нуклеозида остается постоянной для

всех систем 6AZC с ДНК (n = 1), т.е. ЭБ не конкурирует непосредственно за места связывания с 6AZC, а рост константы комплексообразования говорит только о том, что изменения структуры матрицы позволяют молекуле 6AZC увеличить активность связывания с ДНК. По-видимому, увеличение связывания 6AZC с модельными образцами ДНК также произошло из-за нарушения ее нативной вторичной структуры, но такие изменения менее выгодны с точки зрения возможности встраивания нуклеозида.

Індекс рубрикатора НБУВ: Е60*725.112.1

Рубрики:

Загальна зоологія

Шифр НБУВ: Ж29137 Пошук видання у каталогах НБУВ 

---

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"