Перепелиця С. М. Роль протиіонів лужних металів у конформаційній динаміці двоспіральних полінуклеотидів : автореф. дис... канд. фіз.-мат. наук / С. М. Перепелиця; Київ. нац. ун-т ім. Т.Шевченка. - К., 2008. - 19 c. - укp.Розглянуто молекулу двоспірального полінуклеотиду з протиіонами лужних металів як гратку іонного кристалу. Динаміку такої гратки досліджено на базі підходу чотирьох мас Волкова та Косевича, також теорії іонних кристалів. Для визначення електростатичних взаємодій між зарядами подвійної спіралі та протиіонами розроблено спеціальний підхід для оцінювання діелектричної проникності іон-гідратного шару полінуклеотиду та константи Маделунга іон-фосфатної гратки. Одержані значення діелектричної проникності змінюються від 2,3 до 2,6 залежно від типу протиіона. Значення константи Маделунга виявилися близькими до значення одновимірного кристалу (1,386). Показано, що у низькочастотному спектрі двоспіральних полінуклеотидів має існувати мода коливань протиіонів відносно фосфатних груп остова подвійної спіралі. Розраховано частоти іон-фосфатних коливань для полінуклеотидів у висушеному стані та для полінуклеотидів у B- та A-формах подвійної спіралі з протиіонами <$Eroman {Li sup + ,~Na sup + ,~K sup + ,~Rb sup + }> та <$Eroman Cs sup +>. Показано, що за збільшення маси протиіону частота та іон-фосфатних коливань зменшується від 250 до <$E95~ roman см sup -1>. На підставі розрахунку амплітуд конформаційних коливань показано, що легкі протиіони (<$Eroman {Li sup + ,~Na sup + }> і <$Eroman K sup +>), рухаючись відносно фосфатних груп остова макромолекули, не збурюють внутрішньої динаміки подвійної спіралі, а важкі протиіони (<$Eroman Rb sup +> і <$Eroman Cs sup +>) примушують рухатися всі структурні елементи полінуклеотиду. Для спостереження моди іон-фосфатних коливань Індекс рубрикатора НБУВ: В365.11,022 + В365.51,022
Рубрики:
Шифр НБУВ: РА355158 Пошук видання у каталогах НБУВ
Повний текст Автореферати дисертацій Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) ![](/irbis_nbuv/images/info.png) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|