Yesylevskyy S. O. Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques / S. O. Yesylevskyy // Biopolymers and Cell. - 2010. - 26, № 4. - С. 311-316. - Бібліогр.: 24 назв. - англ.Існує кілька методів для визначення ієрархії динамічних доменів у білках. Мета даної роботи полягала у проведенні систематичного аналізу двох нещодавно створених методів - НССР та HDWA - на основі тестового набору білків з різних структурних класів. Використано методи HDWA та НССР. Перший розроблено для визначення ієрархії доменів з використанням траєкторій молекулярної динаміки, тоді як другий грунтується на нормальних коливаннях спрощеної еластичної моделі білка. Встановлено, що динамічні домени, знайдені за допомогою методу HDWA, добре узгоджуються з доменами, визначеними за методом НССР та із застосуванням інших підходів. У той же час HDWA правильно визначає рухливі петлі в білках, чого важко досягти іншим способом. Висновки: показано, що HDWA є потужним методом аналізу траєкторій молекулярної динаміки для багатодоменних білків. Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.3*01
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ
Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|