Мета роботи - повний конформаційний аналіз ізольованої молекули 5'-дезоксигуанілової кислоти (дГК). Конформацію молекули описано за допомогою торсійних кутів beta = PO5'C5'C4', gamma = O5'C5'C4'C3', epsilon = C4'C3'O3'HO3', chi = O4'C1'N9C4, alpha' = C5'O5'POP, zeta1 = O5'POP1HP1, zeta2 = O5'POP2HP2, кута P та амплітуди numax псевдообертання фуранозного кільця. Стартові геометрії побудовані, виходячи з одержаних раніше повних конформаційних сімейств молекул 2'-дезоксигуанозину, метилдигідрофосфату та 1,2-дидезоксирибофуранози-5-фосфату. Оптимізацію геометрії виконано на рівні теорії DFT B3LYP/6-31G(d,p), а розрахунок електронних енергій - МР2/6-311++G(d,p). Виявлено 745 конформерів ізольованої молекули дГК із відносними енергіями Гіббса за нормальних умов в межах <$E 0~symbol Ш~16,4> ккал/моль. Охарактеризовано конформаційну мінливість довжин хімічних зв'язків, валентних кутів та ендо- і екзоциклічних торсійних кутів нуклеотидної основи. Встановлено, що енергетично найвигідніший конформер має syn-орієнтацію основи та C1'ехо-конформацію фуранозного кільця. Серед знайдених конформерів структура 13 є подібною до нуклеотидів ДНК у її AI-, AII-, BI-, ZI- чи ZII-формах, причому найменшу енергію Гіббса (<$E DELTA G> = 9,1 ккал/моль) серед цих конформерів має BI-ДНК-подібний. Продемонстровано роль внутрішньомолекулярних H-зв'язків у підтриманні просторової структури конформерів.

• Ніколаєнко Тимофій Юрійович (біологічні науки)
• Говорун Дмитро Миколайович (1950–2020) (біологічні науки)

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"