Геном вірусу імунодефіциту людини (ВІЛ-1) надзвичайно гетерогенний. Мета дослідження - провести філогенетичний аналіз структурних елементів області полі(А) ВІЛ-1, зокрема, шпильок поліА і DSE, які складають основний сайт полі(А). Передбачення вторинної структури основного полі(А)-сайта здійснено за допомогою програми UNAFold. Структуру шпильок поліА і DSE проаналізовано для 1679 геномів ВІЛ-1 групи M та 18 геномів вірусу імунодефіциту мавп SIVcpzPtt: у геномах ВІЛ-1 виявлено 244 і 171 різну послідовність шпильок поліА і DSE відповідно. Однак 70 % вивчених геномів містили один із семи варіантів шпильки поліА, які зустрічалися з частотою <$Esymbol У ~5~%> (основні варіанти), і 79 % ізолятів містять один із семи основних варіантів шпильки DSE. Виявлено також специфічні для певного субтипу або країни мутації зазначених шпильок. Встановлено, що шпилька поліА з геному SIVcpzPtt дуже схожа на таку з геному ВІЛ-1 субтипів B і C. Результати проведених широкомасштабних досліджень підтримують деякі структурні моделі 5' нетрансльованої ділянки геному ВІЛ-1, зокрема, третинну взаємодію між шпилькою поліА і областю гена матриксного білка. Шпилька DSE, можливо, утворилася у процесі еволюції ВІЛ-1 групи M. Експонування U/GU-збагаченого елемента в апікальній петлі цієї шпильки могло значно підвищити ефективність поліаденілювання про-мРНК у ВІЛ-1 цієї групи.

 Наукова періодика України 

---

Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
(cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)

• Говорун Дмитро Миколайович (1950–2020) (біологічні науки)

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"