Куклін А. В. Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа / А. В. Куклін, Б. Т. Токовенко, М. Ю. Оболенська // Biopolymers and Cell. - 2013. - 29, № 6. - С. 521-526. - Бібліогр.: 15 назв. - укp.Транскриптом первинних гепатоцитів щура, культивованих з інтерфероном альфа (ІФН<$Ealpha>) впродовж трьох і шести годин, досліджено з залученням олігонуклеотидних мікромасивів. Мета дослідження - здійснити поетапний аналіз результатів мікромасив-експерименту та визначити відповідність або невідповідність критеріїв оцінки результатів загальноприйнятим значенням. Аналіз здійснено на файлах, одержаних після сканування мікромасивів Asymetrix, з використанням статистичного середовища R, пакетів функцій Bioconductor "affy", "simpleaffy", "affyPLM" і програми BRB Array Tools з застосуванням парного T-тесту. Усі мікромасиви пройшли контроль якості, їх нормалізовано та порівнено поміж собою. За результатом T-тесту знайдено 28 і 124 диференційно експресованих гени відповідно після трьох і шести годин культивування клітин з ІФН. Висновки: одержані дані відповідають узвичаєним критеріям якості та придатні для подальшого встановлення їх біологічного значення. Використані в роботі R-коди можна застосовувати під час обробки результатів мікромасив-експериментів. Індекс рубрикатора НБУВ: Е60*669.3*337
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|