Лукашов С. С. Взаємодія ціананових барвників з нуклеїновими кислотами. 23. Комп'ютерне моделювання "напівінтеркаляційної" взаємодії монометинових ціанінових барвників з GCTA:TAGC-фрагментом ДНК / С. С. Лукашов, Г. О. Качковський, С. М. Ярмолюк, Г. Х. Мацука // Біополімери і клітина. - 2001. - 17, № 4. - С. 331-336. - Бібліогр.: 8 назв. - укp.Проведено комп'ютерне моделювання ДНК-комплексів шести пірилієвих і піридинових монометинових ціананових барвників з використанням методів MM+, AMBER, PM3 і CNDO/2 з пакету програм Hyperchem 5,0. Комплекси відповідно до раніше отриманих експериментальних даних побудовано згідно з моделлю "напівінтеркаляції" так, що інтеркалювало лише бензотіазолове ядро. Після оптимізації геометрії така структура комплексів зберігається. Для барвників у вільному стані та в комплексах розраховано розподіл заряду для основного (<$E S sub 0 >) і збудженого (<$E S sub 1 >) станів і визначено потенціальні енергії повертання гетерозалишків навколо зв'язків метинової групи. Величина енергії комплексів корелює зі значеннями інтенсивностей флюорисценції барвників у присутності ДНК. Електронна густина на інтеркалюючому ядрі під час утворення комплексів зростає для всіх барвників, окрім Cyan 40. Це протирічить її реальному перерозподілу, який проявляється, зокрема, у змінах стоксових зсувів. Значення потенціальних енергій обертання вказують на те, що під час утворення ДНК-комплексів жорсткість фіксації планарної конформації молекули барвника значно збільшується. Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.112:Г642.2в6
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) ![](/irbis_nbuv/images/info.png) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|