Методом Монте Карло проведено компьютерное моделирование взаимодействия фрагментов ДНК и производного актиноцина (ActII) с учетом водного окружения. Получены низкоэнергетические молекулярные структуры, соответствующие наиболее вероятным типам взаимодействия - связыванию ActII в малом желобке и интеркаляции ActII в GC-сайт с разной стехиометрией комплексов. Показано, что стабильность комплексов обусловлена Ван-дер-Ваальсовыми и электростатическими взаимодействиями, а также взаимодействием с водным окружением, молекулы которого вносят дополнительную стабилизацию за счет образования мостиков между донорско-акцепторными группами фрагментов ДНК и лигандов. Определены возможные размеры мест связывания ActII в малом желобке ДНК, составляющие 3 - 4 пары нуклеотидов (п. н.) на молекулу лиганда (МЛ). При интеркаляции молекул ActII в GC-сайт размеры мест связывания очевидно больше 4 п. н. на МЛ. Полученные результаты согласуются с данными экспериментальных исследований.

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"