Ніколаєнко Т. Ю. Конформаційна ємність молекули 5'-дезоксиаденілової кислоти: квантово-механічне дослідження методом функціонала густини / Т. Ю. Ніколаєнко, Л. А. Булавін, Д. М. Говорун // Укр. біохім. журн.. - 2011. - 83, № 4. - С. 16-28. - Бібліогр.: 32 назв. - укp.За допомогою квантово-механічного методу функціонала густини на рівні теорії MP2/6-311++G(d,p)//DFT B3LYP/6-31G(d,p) проведено повний конформаційний аналіз молекули 5'-дезоксиаденілової кислоти. Виявлено 726 її конформерів із відносними енергіями Гіббса від 0 до 12,1 ккал/моль за нормальних умов. Встановлено, що енергетично найвигіднішою є структура із "північною" (N) конформацією фуранозного кільця та syn-орієнтацією нуклеотидної основи, стабілізована внутрішньомолекулярними водневими зв'язками OP1HP1...N3 та O3'H...OP. Структура чотирьох із виявлених конформерів подібна до структури нуклеотидів ДНК у AI- і чотирьох - у BI-формі. Структура одного із одержаних конформерів 5'-дезоксиаденілової кислоти (з відносною енергією <$E DELTA G> = 5,4 ккал/моль) близька до відомої кристалічної структури гідрату натрієвої солі цієї молекули, встановленої за допомогою методів рентгеноструктурного аналізу. Показано, що найчутливішими до конформації молекули є заряди атомів C4' і C5'. Продемонстровано роль внутрішньомолекулярних водневих зв'язків типу OH...N у формуванні просторової структури молекули. Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.112.711.1
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) ![](/irbis_nbuv/images/info.png) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|