Tanchuk V. Yu. Analysis of conformational flexibility of loop 110 - 120 of protein tyrosine phosphatase 1B / V. Yu. Tanchuk, V. O. Tanin, A. I. Vovk // Укр. біохім. журн.. - 2013. - 85, № 5. - С. 73-80. - Бібліогр.: 23 назв. - англ.Конформації каталітичного центру протеїнтирозинфосфатази 1B (PTP1B) та оточуючих петель відіграють важливу роль у каталізі й інгібуванні ензиму. 98 конформацій з 88 PDB файлів, які представлено PTP1B із різними лігандами, проаналізовано з метою дослідження особливостей рухливості петлі 110 - 120 та її окремих залишків. Відмінності виявлено за допомогою спеціального програмного забезпечення, яке проводить багаторазове порівняння обраних частин PDB файлів. Конформації розподілено на 6 кластерів. Виявлено, що петля, яка сформована залишками 110 - 120, може бути охарактеризована чотирма основними положеннями. Вона характеризується, переважно, основною конформацією і зберігає її під час руху WPD петлі. Три інші конформації є стабільними у разі закритої WPD петлі та, ймовірно, є вірогіднішими для РТР1В із субодиничною структурою. Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.4*011
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ Повний текст Наукова періодика України Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|