Ostash B. Homologues of pleotropic regulatory gene adpA in Actinoplanes: analysis in silico / B. Ostash, N. Zaburannyi, L. Horbal, A. Luzhetskyy, S. Shulga, V. Fedorenko // Вісн. Львів. ун-ту. Сер. біол.. - 2012. - Вип. 60. - С. 156-162. - Бібліогр.: 18 назв. - англ.Actinoplanes teichomyceticus продукує глікопептидний антибіотик тейкопланін, що є антибіотиком "останньої лінії оборони" проти мультирезистентних коків. Кластер генів біосинтезу тейкопланіну (tcp) клоновано 8 років тому, хоча регуляція продукції цього антибіотика погано зрозуміла внаслідок браку розроблених методів генетичних маніпуляцій цим видом, а також відсутності даних про будову геному A. teichomyceticus. У стрептоміцетів регуляторний ген adpA кодує один із ключових регуляторів вторинного та первинного метаболізму, а також морфогенезу, формуючи найбільший на сьогодні генний "модулон", що описано у бактерій. Проаналізовано гіпотезу про те, що AdpA-подібний білок може бути задіяно у регуляції продукції тейкопланіну. Використовуючи описану консенсусну операторну послідовність AdpA для стрептоміцетів, здійснено пошук відповідних операторів у tcp-кластері. Виявлено кілька імовірних операторів AdpA, що вказує на те, що AdpA-залежна регуляція може функціонувати в Actinoplanes. З використанням низки методів порівняльної геноміки виявлено кілька гомологів adpA у повністю просеквенованих геномах Actinoplanes, а також у чорновій послідовності геному A. teichomyceticus. У сумі наші дані узгоджуються з припущенням, що adpA-залежна регуляція впливає на продукцію антибіотиків не тільки в роді Streptomyces, але й в роді Actinoplanes. Індекс рубрикатора НБУВ: Е40*444*721 + Е422.382.11*44
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж28852/б. Пошук видання у каталогах НБУВ Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|