Babichev S. A. Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer = Комп'ютерний аналіз мікромасивів профілів експресії генів раку легенів / S. A. Babichev, A. I. Kornelyuk, V. I. Lytvynenko, V. V. Osypenko // Biopolymers and Cell. - 2016. - 32, № 1. - С. 70-79. - Бібліогр.: 16 назв. - англ.Мета роботи - проведення досліджень щодо оптимізації методів, що використовуються у процесі обробки профілів експресії генів, з метою підвищення якості кластеризації об'єктів. Передобробку даних було виконано у програмному середовищі R з використанням пакету "Біокондуктор". Моделювання процесу кластеризації було зроблено у програмному середовищі KNIME з використанням функцій програми WEKA. Показано, що оптимальним є процес передобробки даних з використанням методів: фонової корекції rma за методом, квантільної нормалізації, mas РМ корекції і сумарізації за mas методом. Результати моделювання показали високу ефективність використання для даного типу даних алгоритму кластеризації Sota. Висновки: проведені дослідження показали, що підвищення якості розподілу об'єктів біологічної природи на кластери можливо за рахунок гібридизації та оптимізації використання методів і алгоритмів на різних етапах обробки даних. Індекс рубрикатора НБУВ: Е70*445.4 + Р569.423
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ Повний текст Наукова періодика України Додаткова інформація про автора(ів) публікації: (cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці) Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|