На основі комплексних досліджень структури геному і ряду біологічних ознак одержано нові дані з екології, систематики та синтезу біологічно активних сполук типовим штамом-продуцентом високоефективного антистафілококового антибіотика батуміну Pseudomonas batumici УКМ В-321 і широко розповсюджених у Світовому океані штамів Alteromonas macleodii. Таксономічним аналізом показано, що P. batumici являє собою новий вид бактерій. Повним сіквенсом геному типового штаму P. batumici УКМ В-321 методом Illumina Hi-Seq встановлено, що ДНК штаму містить 127 контигів загальною довжиною 6608172 п.н. Ідентифіковано оперон біосинтезу батуміну, який складається з 77000 п.н., містить 28 кодуючих генів і має більший Г + Ц вміст ДНК; комп'ютерною програмою SeqWord Genomic Island Sniffer встановлено горизонтальний перенос оперону батуміну. Найбільш філогенетично близькими до P. batumici УКМ В-321 видами виявилися P. gingeri і P. protegens, однак у них був відсутній оперон біосинтезу батуміну. HPLC-аналіз культуральної рідини P. batumici УКМ В-321 показав наявність у ній батуміну; в культуральній рідині P. gingeri батумін або його аналоги були відсутніми. Вивчено фенотипові, хемотаксономічні і генетичні властивості 5 глибоководних морських штамів A. macleodii, ізольованих з глибини 1000 - 3500 м та 5 штамів, виділених з поверхневих шарів води. Методом електронної мікроскопії встановлено, що глибоководні штами виявилися вдвічі довшими (<$E2,1~symbol С~0,2~times~0,7~symbol С~0,1> мкм), аніж поверхневі (<$E1,1~symbol С~0,1~times~0,6~symbol С~0,1> мкм). Аналіз жирнокислотних профілів глибоководних і поверхневих штамів дозволив розділити їх на два кластери. Знайдена різниця у лектинзв'язуючій активності штамів, виділених з різних глибин, свідчила про їх різні за структурою екзополісахаридні матрикси. Аналіз результатів ПЛР з ДНК-маркерами показав більш високий рівень поліморфізму у поверхневих штамів у порівнянні з глибоководними. Знайдено особливості штамів A. macleodii, очевидно, є відображенням специфічних умов існування, в яких вони знаходяться на поверхні або в глибинах Світового океану.

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"