РЕФЕРАТИВНА БАЗА ДАНИХ "УКРАЇНІКА НАУКОВА"
Abstract database «Ukrainica Scientific»


Бази даних


Реферативна база даних - результати пошуку


Вид пошуку
Пошуковий запит: (<.>ID=REF-0000651087<.>)
Загальна кількість знайдених документів : 1

Фролова А. О. 
Крос-платформне об'єднання даних мікромасив-експериментів та його вплив на значення генної експресії при аналізі зразків ракових пухлин молочної залози людини / А. О. Фролова, В. С. Бондаренко, М. Ю. Оболенська // Мед. інформатика та інженерія. - 2016. - № 2. - С. 5-14. - Бібліогр.: 23 назв. - укp.

У різних галузях біології та медицини накопичилася значна кількість даних широкомасштабних досліджень генної експресії за використання мікромасив-технологій. Тому виникає нагальна потреба у порівнянні, об'єднанні й аналізі цих даних з метою підвищення інформативності та статистичної достовірності результатів аналізу. Однак, процес об'єднання результатів мікромасив-експериментів на базі крос-платформного аналізу ускладнений існуванням багатьох мікроарей-платформ, різних за технологією виготовлення, методикою нанесення проб на чип і різновидністю дизайну проб. Ці особливості кожного з досліджень повинні було враховано під час оброблення й аналізу результатів мікромасив-експериментів, одержаних як на однакових, так і на різних платформах. Мета роботи - дослідити як різні способи оброблення та об'єднання даних мікромасив-експериментів за використання різних платформ впливають на значення генної експресії. Зміни у процесі оброблення мікромасив-експериментів впливають на результати даних експресії. Реанотація проб на сучасні версії баз даних геномних/транскриптомних послідовностей надає більш точний результат. Також вибір пробсетів на основі відповідності проб до послідовності конкретного гена (його транскриптів), а саме підходи, показані проектом BrainArray та використаними авторами оцінками специфічності та чутливості проб, надають більш зважені та подібні результати, що відображено в аналізі кореляції експресії генів між різними варіантами обробки та кластерному аналізі профілей генної експресії. Об'єднання даних із різних досліджень допомагає одержати більш прогнозовану похибку під час класифікації зразків ракових пухлин молочної залози людини за молекулярними підтипами даних, ніж за використання даних із окремих досліджень. Цей результат слугує підгрунтям для використання саме такого підходу під час дослідження проблем, що пов'язані з класифікацією будь-яких біологічних даних, особливо якщо заздалегідь інформація про зразки невідома, а також спонукає до подальшого дослідження впливу злиття данних на значення генної експресії.


Індекс рубрикатора НБУВ: Р569.133.1

Рубрики:

Шифр НБУВ: Ж25988 Пошук видання у каталогах НБУВ 
Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
(cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)
  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
 
Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського
Відділ наукового формування національних реферативних ресурсів
Інститут проблем реєстрації інформації НАН України

Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського