Цель исследования - определить сходство в организации crt-кластеров 8 штаммов, входящих в S. albus кладу. Показать возможность использования строения crt-кластеров для классификации стрептомицетов до таксонов низшей иерархии. Сравнительный анализ in silico первичных структур хромосомной ДНК ряда стрептомицетов из базы данных "Nucleotide collection" на сервере NCB1 проводили с помощью программ blastn и bl2seq из пакета BLAST. Установлено наличие сходств в строении crt-кластеров 8 штаммов (4 штаммов как признанных членов S. albus группы: J1074, DSM 41398, SM254, ВК3-25, так и 4 выбранных для исследований как вероятных ее членов: S. sampsonii KJ40, Streptomyces sp. GBA 94-10, Streptomyces sp. PVA 94-07, Streptomyces sp. FR-008). Показано, что все 8 crt-кластеров состоят из 2 конвергентных оперонов. Выявлено отсутствие в них crtT-генов. Во всех 8 кластерах обнаружены вставки из дополнительных генов, продукты которых не участвуют в синтезе каротиноидов. В кластерах 6 штаммов (из 8 изучаемых) они локализованы между оперонами, за исключением штаммов S. albus subsp. albus DSM 41398 и ВК3-25, у которых дополнительные гены расположены между генами crtY и crtU. Выводы: сделано предположение, что характерные особенности организации crt-кластеров стрептомицетов могут быть полезными в классификации микроорганизмов до таксонов низшей иерархии (клады, вида, подвида) в дополнение к уже используемым генетическим и фенотипическим характеристикам.

 Наукова періодика України 

---

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"