Gerashchenko G. V. A role of expression level of reference and investigated genes in prostate tumors for qPCR analysis = Роль рівнів експресії референсних та досліджуваних генів при раку передміхурової залози у кПЛР аналізі / G. V. Gerashchenko, E. O. Stakhovsky, L. I. Chashchina, O. P. Gryzodub, V. I. Kashuba // Biopolymers and Cell. - 2018. - 34, № 2. - С. 85-96. - Бібліогр.: 19 назв. - англ.Мета роботи - визначити профілі експресії пухлино-асоційованих генів у пухлинах передміхурової залози (ПЗ) з використанням різних протоколів нормалізації (з одно-, дво- та чотириреференсними генами АБО з одним, двома та чотирма референсними генами) та оптимізувати комбінації референсних генів для розрахунку відносної експресії (ВЕ) у раку ПЗ. Кількісною ПЛР (кПЛР) проаналізовано ВЕ 23 генів у 37 зразках тканин ПЗ (Т) з різними показниками Глісона та різними стадіями пухлин у порівнянні з 37 умовно-нормальними зразками тканини ПЗ (УНТ) та 20 зразками аденом ПЗ. Теоретичні розрахунки відхилення ВЕ не підтвердили впливу значень рівнів експресії на цей параметр ані у ВЕ референсного гена, ані у ВЕ досліджуваних генів. Експермиментальні дані, які було одержано, з використанням <$E2 sup -{ DELTA DELTA Ct} > моделі, показали статистичні значущі відмінності у експресії 17 з 23 досліджуваних генів, за порівняння парних T/УНТ. Показники ВЕ, розраховані з використанням моделі <$E2 sup -{ DELTA Ct }>, показали високий рівень співпадіння статистичних даних у всіх групах референтних генів для груп аденокарциноми-УНТ-аденоми (понад 82 %). Слід зазначити, що за розподілення за стадіями співпадіння статистичних даних встановлено у 69 % випадків, а за показниками Глісона - у 64,5 %. Висновки: всі три типи референсних генів, як і було передбачено, можуть бути використані для нормалізації ВЕ у зразках пухлини ПЗ. Використання моделей <$E2 sup -{ DELTA DELTA Ct }> або <$E2 sup -{ DELTA DELTA DELTA Ct }> не має впливу на рівень ВЕ для референсних генів. Найважливішим фактором була їх стабільна експресія. Важливими параметрами для вибору порогу відмінностей рівнів експресії між групами з метою правильної інтерпретації даних є рівні експресії досліджуваних генів, величина зміни значень ВЕ, розмір вибірки та висока гетерогенність експресії. Індекс рубрикатора НБУВ: Е70*445.4 + Р569.696.2
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ
Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|