РЕФЕРАТИВНА БАЗА ДАНИХ "УКРАЇНІКА НАУКОВА"
Abstract database «Ukrainica Scientific»


Бази даних


Реферативна база даних - результати пошуку


Вид пошуку
Пошуковий запит: (<.>ID=REF-0000699037<.>)
Загальна кількість знайдених документів : 1

Vitrenko Ya. A. 
A dual-target strategy for the detection of Chlamydia trachomatis by real-time PCR = Двоцільова стратегія виявлення Chlamydia trachomatis за допомогою ПЛР у реальному часі / Ya. A. Vitrenko, O. M. Deryabin // Biopolymers and Cell. - 2018. - 34, № 2. - С. 117-128. - Бібліогр.: 20 назв. - англ.

Мішенню тестів діагностики C. trachomatis першого покоління є криптична плзміда. Нещодавно відкриті штами без цільового сегмента ДНК (т.зв. "Шведскі" варіанти) або повністю позбавлені плазміди не діагностуються ПЛР. Запропоновано використовувати хромосомний ген як додаткову мішень, що надасть змогу підстрвахувати плазмідний ПЛР-тест і може підвищити загальну ефективність діагностики. Мультиплексну систему з двох ПЛР було складено для одночасної детекції криптичної плазміди і фрагмента гена 16s pРНК. Праймери на 16s pРНК можуть давати сигнал ПЛР під час аналізу ряду видів Chlamydia. Додавання зонда типу Taqman (необхідного для ПЛР в реальному часі) звужує спектр виявляв видів до C. trachomatis. У той же час, ПЛР з плазміди володіє специфічністю виключно до C. trachomatis. Встановлено, що чутливість ПЛР з плазміди і гена 16s pРНК досягала від 1 до 10 геном-еквівалентів на реакцію, а ефективність - близько 100 %. Реакція в мультиплексі не зменшує аналітичну чутливість. Додавання до реакційної суміші ДНК клінічних зразків не впливало на ПЛР з чистою ДНК C. trachomatis, що також демонструє надійність системи. Кінетику цих двох реакцій проаналізовано на 49 зразках ДНК з мазків, позитивних до C. trachomatis. Для 45 зразках показано хорошу кореляцію порогових циклів ампліфікації Cq і основного аналітичного параметра ПЛР у реальному часі. Висновки: одночасна детекція хромосомної і плазмідной мішені в мультиплексній ПЛР забезпечує високу чутливість і має перевагу під час аналізу зразків з втраченою плазмидою через деградацію ДНК або контрселекціі за терапії. Двоцільова стратегія ПЛР, може бути основою для ефективного внутрішньолабораторного або комерційного діагностичного тесту.


Індекс рубрикатора НБУВ: Е422.212.1*44 + Е40*441.147 + Р59-45

Рубрики:

Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ 
  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
 
Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського
Відділ наукового формування національних реферативних ресурсів
Інститут проблем реєстрації інформації НАН України

Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського