Mishchenko L. T. Phylogenetic analysis of Ukrainian seed-transmitted isolate of Soybean mosaic virus = Філогенетичний аналіз українського ізоляту вірусу мозаїки сої, який передається насінням / L. T. Mishchenko, A. A. Dunich, I. S. Shcherbatenko // Biopolymers and Cell. - 2018. - 34, № 3. - С. 229-238. - Бібліогр.: 27 назв. - англ.Вірус мозаїки сої (ВМС) передається насінням і може спричиняти значні зниження врожаїв та якості насіння рослин сої (Glycine max). Ступінь насіннєвої передачі різних ізолятів ВМС складає 0 - 43 %. Питання про те, які саме гени ВМС задіяні у процесі насіннєвої передачі його ізолятів, досі залишається відкритим. Філогенетичних досліджень для українських ізолятів ВМС, які передаються насінням, не проводилось. Мета дослідження - провести філогенетичний аналіз гена CP ізоляту ВМС, який передається насінням. Здійснено виділення тотальної РНК із рослинного матеріалу, RT-PCR, сиквенування, філогенетичний аналіз. Вперше проведено філогенетичний аналіз послідовностей ділянки (430 нт) гена капсидного білка ВМС ізоляту SKS-18, який передається насінням. Найвищий відсоток ідентичності за нуклеотидною (98,8 %) та за амінокислотною (98,6 %) послідовністю ізолят SKS-18 має з іранськими ізолятами Ar33, Lo3, американським ізолятом VA2, а також українським ізолятом UA1Gr. У досліджуваній ділянці гену CP ізоляту SKS-18 виявлено унікальні амінокислотні заміщення у позиціях 1 (Ser <$Esymbol О> Cys) та 2 (Lys <$Esymbol О> Ala). Висновки: ізолят SKS-18 локалізується в одному кластері з ізолятами з найбільшою ідентичністю нуклеотидів, що може бути наслідком їх подібної мінливості. Унікальні амінокислотні заміщення у досліджуваній ділянці гену CP ізоляту SKS-18 можуть бути залучені до насіннєвої передачі вірусу та інших важливих функцій інфекційного циклу, з'ясування яких необхідне для розроблення ефективних засобів захисту рослин від вірусних хвороб. Індекс рубрикатора НБУВ: Е325.222.27 + П491.136.07 + П478.29
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ
Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|