Дослідження молекулярних характеристик, зокрема, нуклеотидних (нт) та амінокислотних (аа) послідовностей вірусних геномів, є необхідним для з'ясування змін у географічному ареалі, філогенетичних зв'язків, еволюції вірусів та їх появи у вигляді епідемій. Мета роботи - філогенетичний аналіз гену капсидного білка (CP) двох нових українських ізолятів вірусу смугастої мозаїки пшениці (ВСМП) Ukraine-Mal-18 та Ukraine-Ep-18. Здійнено імуноферментий аналіз, виділення тотальної РНК із рослинного матеріалу. У досліджені використано полімеразну ланцюгову реакцію зі зворотною транскрипцією, сиквенування, філогенетичний аналіз. Послідовності гену CP розміром 676 нт двох українських ізолятів ВСМП порівнювали із послідовностями 72 ВСМП ізолятів/штамів із бази даних GenBank. Філогенетичний аналіз показав, що українські ізоляти входять до клади B або WSMV-<$EDELTA E> (походять із Європи та Азії) та мають типову для цієї клади делецію триплету у позиціях 8412 - 8414 нт у гені CP. Ukraine Mal-18 має найвищий відсоток ідентичності за нуклеотидною послідовністю 93,5 - 95,9 %, за амінокислотною - 93,6 - 95,0 % із ізолятами клади B. Ізолят Ukraine-Ep-18 із ізолятами клади B має ідентичність 89,2 - 91,4 % (нт) та 88,6 - 87,1 % (аа). Крім того, у двох українських ізолятів відмічено низку унікальних аа заміщень в центральній ділянці гену CP. Висновки: українські ВСМП ізоляти входять до клади B. Але Ukraine-Mal-18 та Ukraine-Ep-18 мають деякі відмінності від них: вищу дивергенцію, ніж інші ізоляти групи B (Ukraine-Mal-18 має 12 аа заміщень, Ukraine-Ep-18 має 25 аа заміщень, а інші ізоляти клади В мають 0-2 аа заміщення); мають аа заміщення, ідентичні із непшеничними ізолятами групи B1 цього вірусу, багато аа заміщень знаходяться в тих самих ділянках гену CP, що і заміщення трав'яних B1 ізолятів ВСМП.

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"