Kutuzov M. M. Optimization of nucleosome assembling from histones and model DNAs and estimation of the reconstitution efficiency = Оптимізація протоколу збірки нуклеосом з використанням гістонів і модельних ДНК-дуплексів і оцінка ефективності процесу реконструкції / M. M. Kutuzov, T. A. Kurgina, E. A. Belousova, S. N. Khodyreva, O. I. Lavrik // Biopolymers and Cell. - 2019. - 35, № 2. - С. 91-98. - Бібліогр.: 12 назв. - англ.Нуклеосомна корова частка, НКЧ, являє собою зручну модельну систему для вивчення ключових ДНК-залежних процесів, оскільки є елементарною одиницею структури хроматину. Саме тому основним завданням представленого дослідження було створення універсального методу збірки нуклеосом. Для реконструкції НКЧ використовуються очищені гістони і ДНК-структури з певними послідовностями, що забезпечують чітке позиціонування ДНК відносно октамера гістонів. Це вимагає наявності способу контролю ефективності реконструкції НКЧ. Мета роботи - оптимізувати процедуру реконструкції НКЧ з очищених октамер гістонів і різних типів синтезованих модельних ДНК і запропонувати підхід для експрес-аналізу ефективності цього процесу. Під час дослідження здійснено діаліз, поділ в ПААГ, вимір флуоресценції з використанням барвника Eva-Green. Розроблено зручну процедуру складання НКЧ в слабо сольовому буфері зі змінним співвідношенням ДНК-гістони на першому етапі. Після визначення оптимального співвідношення реконструкція НКЧ може бути проведена за допомогою повільного градиентного діалізу. На цьому етапі ефективність процесу може бути оцінена безпосередньо в розчині з використанням барвника Eva-Green. Висновки: показано, що ефективність интеркаляції барвника в дуплекс ДНК в контексті нуклеосоми різко знижується. До основних переваг запропонованого підходу можна віднести швидкий аналіз суміші безпосередньо в розчині і можливість використання ДНК, що не містять будь-яких спеціальних міток. Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*551.23 + Е0*551.37
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ
Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|