РЕФЕРАТИВНА БАЗА ДАНИХ "УКРАЇНІКА НАУКОВА"
Abstract database «Ukrainica Scientific»


Бази даних


Реферативна база даних - результати пошуку


Вид пошуку
Пошуковий запит: (<.>ID=REF-0000754426<.>)
Загальна кількість знайдених документів : 1

Винницька Р. Б. 
Фармакофорна модель для скринінгу протистафілококової активності серед тіазолідинон-споріднених структур / Р. Б. Винницька, О. Т. Девіняк, А. В. Лозинський, С. М. Голота, Г. О. Деркач, Я. І. Деяк, Р. В. Куцик, Р. Б. Лесик // Журн. орган. та фармацевт. хімії. - 2020. - 18, вип. 4. - С. 44-49. - Бібліогр.: 15 назв. - укp.

Мета роботи - розробити фармакофорну модель, придатну для скринінгу протистафілококової активності серед похідних тіазолідинону, тіопірано[2,3-d]тіазолу, тіазоло[4,5-b]піридину. Найкраща фармакофорна модель у серії розроблених має планарну структуру та складається з ароматичного кільця (або циклу з <$E pi>-зв'язками), гідрофобної області, проєкції донора водневого зв'язку та двох проєкцій акцептора водневого зв'язку. Її точність класифікації становить 72,4 %. Лінія діаметра моделі утворена проєкцією донора та проєкцією акцептора водневого зв'язку, а її довжина дорівнює 8,05 ангстрем. Під час аналізу узгоджених із фармакофорною моделлю конформацій активних сполук виявлено 2 різні способи просторового розміщення активних молекул, за яких повною мірою виконуються умови фармакофорної моделі. Протистафілококову активність визначено методом дифузії в агар щодо резистентного до метициліну штаму Staphylococcus aureus та оцінено шляхом вимірювання діаметра зони інгібування мікробного зростання. Планшети інкубували протягом 24 год за 37 <^>oC. Сполуки з діаметром затримки розмноження мікроорганізмів понад 7,5 мм вважали активними. Комп'ютерне оброблення результатів мікробіологічного експерименту та моделювання ймовірного фармакофора виконано в програмному середовищі MOE версії 2007.09. Геометрію сполук оптимізовано методом молекулярної механіки з використанням силового поля MMFF94x. Точність класифікації використано як основний критерій оцінювання якості фармакофорної моделі. Розроблену фармакофорну модель можна використовувати для віртуального скринінгу протистафілококової активності споріднених із навчальною вибіркою сполук. Під час застосування цієї моделі до бази даних протестованих сполук з'ясовано, що фактор збагачення складає EF = 2,05.


Індекс рубрикатора НБУВ: Г262.5-4 + Р281.81

Рубрики:

Шифр НБУВ: Ж24793 Пошук видання у каталогах НБУВ 
Повний текст  Наукова періодика України 
Додаткова інформація про автора(ів) публікації:
(cписок формується автоматично, до списку можуть бути включені персоналії з подібними іменами або однофамільці)
  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
 
Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського
Відділ наукового формування національних реферативних ресурсів
Інститут проблем реєстрації інформації НАН України

Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського