Polishchuk L. V. Similarity of genomic sequences of five Streptomyces globisporus strains = Схожість послідовностей геномів п'яти штамів виду Streptomyces globisporus / L. V. Polishchuk // Мікробіол. журн. - 2020. - 82, № 1. - С. 43-50. - Бібліогр.: 18 назв. - англ.Актуальність проведеного дослідження полягає в тому, що його результати, по-перше, будуть корисними при класифікації стрептоміцетів до таксонів нижчого порядку, по-друге - використовуватимуться в дослідженнях щодо еволюції організмів на молекулярному рівні. Аналогічні дослідження широко проводяться на генах домашнього господарства (наприклад, 16S рРНК). Однак цікаво вивчити успішність застосування в таких дослідженнях генів, що визначають необов'язкові білки. Мета дослідження - встановити схожість нуклеотидних послідовностей геномних ДНК п'яти штамів виду Streptomyces globisporus і визначити можливість використання при визначенні спорідненості стрептоміцетів аналізу нуклеотидних послідовностей генів, що кодують неважливі для виживання білки або кластери таких генів (на прикладі crt-генів). Первинні структури геномів 5-ти штамів S. globisporus C-1027, TFH56, NRRL B-2709, NRRL B-2293 і 1912-4Сrt були об'єктами досліджень. Інформацію отримано з баз даних сервера NCBI. Комп'ютерний аналіз послідовності геномів стрептоміцетів проведено за допомогою програм BLAST. Послідовності геномів 5-ти штамів S. globisporus проаналізовано за допомогою програми BLAST. Виявлено схожість багатьох їх характеристик, але визначено також існування багатьох відмінностей у послідовностях цих геномів. Виявлено, що нуклеотидна послідовність геному (як всього геному, так і його окремих фрагментів) штаму S. globisporus NRRL B-2293 найбільш відрізняється значеннями аналізованих характеристик від послідовностей інших 4-х штамів. Передбачено, що необхідно переглянути належність штаму NRRL B-2293 до виду S. globisporus. Ексклюзивна організація його crt-кластера може слугувати вдалим прикладом такого роду. При проведенні класифікації буде корисно (як додаток до характеристик геному, що традиційно використовуються) аналізувати як факультативні гени, так і кластери генів - їх присутність в геномах стрептоміцетів, рівень схожості нуклеотидних послідовностей генів та організацію кластерів генів. Індекс рубрикатора НБУВ: Е422.384.3*99
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж22205 Пошук видання у каталогах НБУВ Повний текст Наукова періодика України
Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|