Увагу приділено з'ясуванню можливості фосфорилювання тубуліну рослин за участю різних типів кальцій-залежних (СРК) протеїнкіназ, визначенню потенційних сайтів такої модифікації, а також оцінці доцільності використання відомих інгібіторів Ca²⁺-кальмодулін-залежних протеїнкіназ типу 2 (СаМК2) для пригнічення активності рослинних кальцій-залежних протеїнкіназ (CDPK). Проведено пошук CDPK і Ca²⁺-кальмодулін-залежних (CRK) протеїнкіназ рослин, здатних безпосередньо фосфорилювати тубулін, регулюючи таким чином його структурно-функціональні властивості. Шляхом NJ кластеризації послідовностей каталітичних доменів визначено найближчі гомологи серед CDPK і CRK-протеїнкіназ з A. thaliana та СаМК2 тварин, участь яких у регуляції структури та функцій цитоскелету експериментально доведено. Найближчими гомологами для протеїнкіназ СаМК2 визначено СРК7, СРК14, СРК32 та СРК21; рибосомальних S6 кіназ (RSK) - СРК17, СРК34, CRK2; кіназ, асоційованих з апоптозом (DAPK) - СРК20, СРК27; чекпоінт-кінази 2 (СНК2) - СРК16, СРК18, СРК28, CRK4 та CRK6. Проведено кластеризацію профілів експериментально підтверджених сайтів фосфорилювання, характерних для CDPK і CRK протеїнкіназ ссавців. У ході профільного аналізу визначено клади різного порядку, що поєднують схожі сайти фосфорилювання білків та асоційовані з ними протеїнкінази ссавців. На основі створених профілів сайтів фосфорилювання знайдено консенсусні послідовності у складі різних ізотипів тубулінів A. thaliana та визначено протеїнкінази, здатні фосфорилювати рослинні тубуліни - кальцій-/кальмодулін-залежну протеїнкіназу типу 1А (СаМК1А), кальцій-/кальмодулін-залежну протеїнкіназу типу 2А (СаМК2А), кальцій-/кальмодулін-залежну протеїнкіназу кіназу 2 (СаМКК2) з Н. sapiens та СаМК2А з R. norvegicus. Визначено їх найближчі гомологи серез протеїнкіназ A. thaliana: СРК20, СРК21 та кіназа взаємодії з гемінівірусним Rep 2 (GRIK2). Таким чином, протеїнкінази СРК20 та СРК21 визначено як рослинні СРК протеїнкінази, що найбільш імовірно здатні фосфорилювати мікротрубочки. Доведено наявність у складі молекул різних субодиниць тубуліну A. thaliana сайтів, що відповідають патернам фосфорилювання СаМК2. Побудовано просторові моделі α- / β-тубулінового димеру та малого γ-тубулінового кільця (γTuSC), за допомогою яких перевірено просторову доступність визначених залишків. Як потенційні сайти фосфорилювання визначено Ser32, Ser259, Ser321 і Ser376 для γ-тубуліну та Thr312 для β-тубуліну. Запропоновано можливу участь визначених сайтів фосфорилювання у формуванні комплексу γTuRC та α- / β-тубулінового димеру.

• Новожилов Дмитро Олегович (біологічні науки)

  Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"