Muratova A. A. Genome analysis of Pseudomonas brassicacearum S-1 - an antagonist of crop pathogens = Аналіз геному бактерій Pseudomonas brassicacearum S-1 - антагоністів фітопатогенів сільськогосподарських культур / A. A. Muratova, A. E. Akhremchuk, L. N. Valentovich // Biotechnologia Acta. - 2021. - 14, № 2. - С. 47-58. - Бібліогр.: 27 назв. - англ.Штам Pseudomonas brassicacearum S-1 є основою біопрепарату екогрін, який застосовують для захисту від патогенів овочевих та зеленних культур в умовах малооб'ємної гідропоніки. Мета роботи 2 секвенування й аналіз нуклеотидної послідовності геному бактерій P. brassicacearum S-1 (код доступу в базі даних ГенБанк CP045701). Повногеномне секвенування проводили за допомогою приладів MiSeq (Illuminа) та MinION (Oxford Nanopore), для аналізу послідовності геному було використано низку біоінформатичних програм. Геном штаму P. brassicacearum S-1 складається з однієї кільцевої хромосоми розміром 6 577 561 пар основ зі вмістом ГЦ-пар 60,8 %. Аналіз геному надав змогу виявити гени, які визначають синтез широкого спектра вторинних метаболітів, що становлять біотехнологічний потенціал штаму S-1. Було визначено локалізацію мобільних генетичних елементів, профагів і коротких повторюваних послідовностей у межах геному штаму S-1. Висновки: виявлені генетичні детермінанти синтезу практично значущих сполук вказують на значний потенціал штаму P. brassicacearum S-1 як агента біоконтролю. Індекс рубрикатора НБУВ: Е422.141.2*440.16
Рубрики:
Шифр НБУВ: Ж100178 Пошук видання у каталогах НБУВ Повний текст Наукова періодика України
Якщо, ви не знайшли інформацію про автора(ів) публікації, маєте бажання виправити або відобразити більш докладну інформацію про науковців України запрошуємо заповнити "Анкету науковця"
|