Простий пошук
|
Розширений пошук
|
Алфавітні покажчики
|
Бази даних
Реферативна база даних - результати пошуку
Віртуальна довідкаТематичний інтернет-навігаторНаукова електронна бібліотекаАвтореферати дисертаційРеферативна база данихКнижкові видання та компакт-дискиЖурнали та продовжувані видання
 |
Для швидкої роботи та реалізації всіх функціональних можливостей пошукової системи використовуйте браузер "Mozilla Firefox" |
|
|
| Сортувати знайдені документи за: | ||
| автором | назвою | роком видання |
| Формат представлення знайдених документів: | ||
| повний | стислий | |
| Знайдено в інших БД: | Журнали та продовжувані видання (1) |
Пошуковий запит: (<.>A=Yarmoluk S$<.>) | ||||
|
Загальна кількість знайдених документів : 37 Представлено документи з 1 до 20 |
||||
| ||||
| 1. | Snihirova Ye. V. Variation of photostability of DNA-sensitive styrylcyanine dyes caused by N-alkyl functionalization = Варіація фотостабільності ДНК-чутливих стирилціанінових барвників, зумовлена природою N-алкільних замісників / Ye. V. Snihirova, M. Yu. Losytskyy, D. V. Kryvorotenko, M. V. Kuperman, O. V. Moshynets, S. M. Yarmoluk, A. Mokhir, V. B. Kovalska // Biopolymers and Cell. - 2020. - 36, № 2. - С. 146-160. - Бібліогр.: 18 назв. - англ. Мета роботи - синтез і характеризація серії N-алкільних функціоналізованих бензтіазол стирилціанінових барвників як потенційних фотостабільних зондів для детекції нуклеїнових кислот (НК). Під час проведення дослідження було застосовано синтез, спектроскопію поглинання і флуоресценції, опромінення барвників видимим світлом, конфокальну мікроскопію. Барвники, що мають слабку флюоресценцію у вільному стані, підвищують інтенсивність емісію у разі зв'язування з ДНК до 83 разів; найбільше підвищення спостерігалось для барвників з позитивно зарядженими N-алкільними замісниками - Sbt1 и Sbt3. Барвники Sbt1 и Sbt3 виявились найменш фотостабільними у вільному стані, але додавання ДНК значно підвищило їх фотостабільність. Барвники з незарядженими та негативно зарядженими N-алкільними замісниками є більш фотостабільними у незв'язаному стані, і присутність ДНК значно не впливає на їх фотостабільність (зокрема завдяки слабкій взаємодії з ДНК барвників з негативно зарядженим замісником). За фарбування мезенхімальних ставбурових клітин, Sbt1 яскраво забарвлював цитоплазму та компоненти ядра (можливо, ядерця), так що імовірно він фарбує цитоплазматичну РНК та кластери РНК у ядрі. Висновки: варіація хімічної природи N-алкільних замісників є способом створення стирилціанінових барвників з різною фотостабільністю. Функціоналізовані стирилціанінові барвники є перспективними як легкі в застосуванні флуоресцентні зонди для детекції нуклеїнових кислот у розчині та візуалізації РНК-містких об'єктів у мікроскопії. Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*715.43 Рубрики: Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 2. | Tarnavskiy S. S. Hit identification of FGFR1 inhibitors using receptor-based virtual screening = Ідентифікація сполук-хітів і інгібіторів FGFR1 методом рецепторно-орієнтовного віртуального скринінгу / S. S. Tarnavskiy, M. V. Protopopov, O. V. Borovykov, A. O. Prykhod'ko, V. G. Bdzhola, S. M. Yarmoluk, V. I. Matyushok, A. O. Balanda // Biopolymers and Cell. - 2019. - 35, № 2. - С. 143-151. - Бібліогр.: 24 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 3. | Kotey I. M. Identification of 4-methoxythieno[2,3-d]pyrimidines as FGFR1 inhibitors = Ідентифікація інгібіторів FGFR1 серед 4-метокситієно[2,3-d]піримідинів / I. M. Kotey, M. V. Protopopov, S. A. Starosyla, A. O. Balanda, L. V. Pletnova, A. O. Prykhod'ko, V. G. Bdzhola, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2019. - 35, № 2. - С. 152-162. - Бібліогр.: 17 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 4. | Pernatii A. Yu. Identification and characterization of potential membrane-bound molecular drug targets of methicillin-resistant Staphylococcus aureus using in silico approaches = Пошук нових молекулярних мішеней, асоційованих з мембраною, для розробки антибіотиків проти метицилін-резистентного штаму Staphylococcus aureus in silico / A. Yu. Pernatii, G. P. Volynets, M. V. Protopopov, A. O. Prykhod'ko, V. M. Sapelkin, L. V. Pletnova, V. I. Matiushok, V. G. Bdzhola, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2019. - 35, № 6. - С. 448-466. - Бібліогр.: 129 назв. - англ. Мета дослідження - пошук нових мішеней для дизайну антибіотиків проти метицилін-резистентного штаму S. aureus (MRSA) за допомогою методів розрахункової протеоміки. У роботі здійснено ідентифікацію негомологічних білків до людського протеому, визначення генів важливих для виживання MRSA та встановлення новизни знайдених мішеней проводили алгоритмами BLAST. За допомогою утиліт бази даних KEGG ідентифікували унікальні метаболічні шляхи бактерій. Клітинну локалізацію протеїнів передбачали програмами PSORT v. 3.0.2, CELLO v. 2.5, iLoc-Gpos, та Pred-Lipo. Гомологічне моделювання проводили веб-серверами SWISS-MODEL, Phyre2, I-TASSER та MODELLER. Початкову вибірку було сформовано з протеомів шести штамів MRSA: ATCC BAA-1680, H-EMRSA-15, LA MRSA ST398, MRSA 252, MRSA ST772, UTSW MRSA 55. Багатостадійний аналіз вибраних протеомів за допомогою алгоритму BLAST надав змогу ідентифікувати дві потенційні молекулярні мішені - диаденілатциклазу та білок DltB, що відповідають заданим вимогам: є важливими для виживання бактерії, є асоційованими з мембранами, не є гомологами людських білків, залучені до унікальних метаболічних шляхів і раніше не досліджувались як терапевтична мішень. Побудовано просторові структури знайдених протеїнів. Висновки: в результаті дослідження за методами лінійної біоінформатики запропоновано дві потенційні мішені - диаденілатциклазу та білок DltB, для подальшої розробки антибіотиків проти метицилін-резистентного штаму бактерії Staphylococcus aureus за допомогою методів раціонального пошуку лікарських засобів. Індекс рубрикатора НБУВ: Е422.241.3*80 + Е0*801-642:Г296 Рубрики: Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 5. | Kuperman M. V. N-alkylaryl styrylcyanine dyes as fluorescent probes for nucleic acids detection = N-алкіларил бензотіазол стирилціанінові барвники для флуоресцентної детекції нуклеїнових кислот / M. V. Kuperman, Ye. V. Snihirova, D. V. Kryvorotenko, M. Yu. Losytskyy, V. B. Kovalska, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2018. - 34, № 5. - С. 374-386. - Бібліогр.: 31 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 6. | Protopopov M. V. Search of protein kinase CK2 inhibitors based on purine-2,6-diones derivatives = Пошук інгібіторів протеїнкінази СК2 серед похідних пурин-2,6-діону / M. V. Protopopov, O. V. Ostrynska, D. H. Ivanchenko, S. A. Starosyla, V. G. Bdzhola, M. I. Romanenko, S. M. Yarmoluk // The Ukr. Biochem. J.. - 2017. - 89, № 5. - С. 32-39. - Бібліогр.: 32 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 7. | Protopopov M. V. Hit identification of CK2 inhibitors by methods of virtual screening = Ідентифікація сполук-хітів і інгібіторів CK2 методами віртуального скринінгу / M. V. Protopopov, S. A. Starosyla, O. V. Borovykov, V. N. Sapelkin, Ya. V. Bilokin, V. G. Bdzhola, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2017. - 33, № 4. - С. 291-301. - Бібліогр.: 30 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 8. | Zinchenko A. N. Synthesis and biological evaluation of novel amino-substituted derivatives of pyrido[2,3-d]pyrimidine as inhibitors of protein kinase CK2 = Синтез та біологічна оцінка нових амінозаміщених похідних піридо[2,3-d]піримідину як інгібіторів протеїнкінази CK2 / A. N. Zinchenko, A. V. Muzychka, O. B. Smolii, V. G. Bdzhola, M. V. Protopopov, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2017. - 33, № 5. - С. 367-378. - Бібліогр.: 41 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 9. | Inshyn D. I. Design of 4-(4-dialkylaminostyryl)-pyridinium dyes for fluorescent detection of amyloid fibrils = Дизайн (4-(4-диалкіламіностирил)-піридинових барвників для флуоресцентної детекції амілоїдних фібрил / D. I. Inshyn, S. V. Chernii, V. B. Kovalska, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2016. - 32, № 4. - С. 289-299. - Бібліогр.: 16 назв. - англ. Патологічна агрегація білків у бета-складчасті фібрилярні структури пов'язана з великою групою важких захворювань, серед яких - нейродегенеративні розлади. У зв'язку з цим актуальною є розробка аналітичних інструментів, зокрема, флуоресцентних зондів, що надають змогу детектувати амілоїдні фібрили. Мета роботи - дизайн амілоїд-чутливих стирилпіридинових флуоресцентних барвників. У роботі застосовано метод QSAR для передбачення чутливості барвників до амілоїдних фібрил, хімічних синтез, спектральні дослідження. Із віртуальної бази на 1500 стирилціанінів були обрані 9 структур із найвищою передбаченою ефективністю. Обрані сполуки були синтезовані, їх спектрально-люмінесцентні властивості було вивчено за присутності амілоїдогенного білка інсуліну. Ці барвники мають низьку власну флуоресценцію та низьку чутливість до мономерного інсуліну. а присутності фібрилярного інсуліну вони можуть збільшувати інтенсивність флуоресценції до десятків разів залежно від природи кінцевого замісника в молекулі барвника. Барвник із 4-метилпіридиновим замісником має найвищу флуоресцентну відповідь (до 23 разів) і широкий діапазон детекції амілоїдних фібрил (1 - 40 мкг / мл). Висновки: (4-(4-диалкіламіностирил)-піридинові барвники з циклічними аліфатичними кінцевими замісниками демонструють перспективні властивості як флуоресцентні зонди для детекції амілоїдних фібрил. Регресійна модель показала хорошу точність передбачення для більшості барвників, виключенням є стирилціаніни, що містять піперазиніловий та інші ароматичні замісники. Індекс рубрикатора НБУВ: Р345 Рубрики: Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 10. | Severinovskaya O. V. Application of MALDI-TOF mass spectrometry for study on fibrillar and oligomeric aggregates of alpha-synuclein / O. V. Severinovskaya, V. B. Kovalska, M. Yu. Losytskyy, V. V. Cherepanov, V. Subramaniam, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2014. - 30, № 3. - С. 190-196. - Бібліогр.: 26 назв. - англ. Мета роботи - вивчення агрегатів альфа-синуклеїну (ASN) різного структурового походження, а саме - амілоїдних фібрил і сферичних олігомерів у порівнянні з нашивним білком. Застосовано методи: MALDI-TOF мас-спектрометрію та атомно-силову мікроскопію (AFM). Мас-спектри нативного та фібрилярного ASN мають подібний характер - для них характерні інтенсивний пік молекулярного іона білка, піки низькомолекулярних асоціатов та досить незначний вміст продуктів фрагментації білка. У той же час у спектрі олігомерних агрегатів спостерігаються висока концентрація продуктів фрагментації білка, низька інтенсивність молекулярного іона та відсутність піків самоасоціатів. Висновки: різницю між спектрами фибрилярного та олігомерного ASN можна пояснити як наявністю у зразках "залишкового" ASN і продуктів деградації білка, так і різними структурово залежними механізмами руйнування цих 2-х видів агрегатів у разі лазерної десорбції/іонізації. MALDI-TOF мас-спектрометрію можна запропонувати як метод вивчення агрегації та аналізу високомолекулярних агрегатів ASN. Також представляє інтерес визначення ефективності цього методу для дослідження агрегатів різних амілоїдогенних білків. Індекс рубрикатора НБУВ: Е60*739.177*72 Рубрики: Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 11. | Ostrynska O. V. Effect of protein kinase CK2 inhibitors on its catalytic subunits СК2$Ebold alpha and СК2$Ebold alpha prime = Вплив інгібіторів протеїнкінази СК2 на її каталитичні субодиниці СК2$Ealpha і СК2$Ealpha prime / O. V. Ostrynska, O. P. Kukharenko, V. G. Bdzhola, S. M. Yarmoluk // Biotechnologia Acta. - 2014. - 7, № 6. - С. 29-39. - Бібліогр.: 32 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж100178 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 12. | Yarmoluk S. M. Rational design of protein kinase inhibitors / S. M. Yarmoluk, A. Yu. Nyporko, V. G. Bdzhola // Biopolymers and Cell. - 2013. - 29, № 4. - С. 339-347. - Бібліогр.: 84 назв. - англ. Сучасні методологічні підходи до раціонального дизайну низькомолекулярних сполук, що характеризуються специфічною активністю щодо заданих біомолекулярних мішеней, розглянуто на прикладі розробки високоефективних інгібіторів протеїнкіназ. Висвітлено нові обчислювальні методи, застосування яких надає змогу суттєво покращити якість комп'ютерних експериментів (зокрема, точність передбачення активності низькомолекулярних сполук) без збільшення розрахункових потужностей та витрати часу. Ефективність стратегії раціонального дизайну підтверджено низкою проведених досліджень з розробки нових інгібіторів протеїнкіназ СК2, FGFR1 і ASK1. Індекс рубрикатора НБУВ: Е0*725.111.4*042 Рубрики: Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 13. | Kovalska V. B. Towards the anti-fibrillogenic activity of phthalocyanines with out-of-plane ligands: irrelation with self-association proneness / V. B. Kovalska, M. Yu. Losytskyy, S. V. Chernii, V. Ya. Chernii, I. M. Tretyakova, S. M. Yarmoluk, S. V. Volkov // Biopolymers and Cell. - 2013. - 29, № 6. - С. 473-479. - Бібліогр.: 12 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 14. | Chernii V. Ya. MALDI mass spectrometry of zirconium and hafnium dibenzoylmethanate phthalocyanines / V. Ya. Chernii, O. V. Severinovskaya, V. B. Kovalska, I. N. Tretyakova, M. Yu. Losytskyy, S. M. Yarmoluk, S. V. Volkov // Укр. хим. журн. - 2012. - 78, № 11/12. - С. 20-25. - Библиогр.: 11 назв. - англ.
Шифр НБУВ: Ж21854 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 15. | Volynets G. IBIn silicoD design of novel small-molecule inhibitors of ASK1 / G. Volynets, V. Bdzhola, S. Yarmoluk // Укр. біохім. журн.. - 2009. - 81, № 4 (спец. вип.). - С. 135. - англ.
Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 16. | Tukalo M. Aminoacyl-tRNA synthetases as targets for antibacterial agents / M. Tukalo, V. Bdzhola, V. Golub, O. Gudzera, G. Yaremchuk, S. Yarmoluk // Укр. біохім. журн.. - 2009. - 81, № 4 (спец. вип.). - С. 49. - англ.
Шифр НБУВ: Ж21341/а Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 17. | Chekanov M. A. Synthesis and optimization of 2-phenylisothiazoiidin-3-one-1,1-dioxides as inhibitors of human protein kinase CK2 / M. A. Chekanov, A. R. Synyugin, S. S. Lukashov, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2009. - 25, № 5. - С. 347. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 18. | Synyugin A. R. A design of protein kinase CK2 inhibitors based on the 2-oxy-1,2-dihydroquinolin-3-il acetamides derivatives / A. R. Synyugin, M. A. Chekanov, S. S. Lukashov, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2009. - 25, № 5. - С. 366. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 19. | Gryshchenko A. A. Identification of novel FGFR1 tyrosine kinase inhibitors / A. A. Gryshchenko, V. G. Bdzhola, O. P. Kukharenko, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2009. - 25, № 5. - С. 352. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| 20. | Sovetova O. V. Search for inhibitors of human protein kinase ASK1 / O. V. Sovetova, O. P. Kukharenko, V. G. Bdzhola, G. P. Volynets, S. M. Yarmoluk // Biopolymers and Cell. - 2009. - 25, № 5. - С. 364. - англ.
Шифр НБУВ: Ж14252 Пошук видання у каталогах НБУВ | |||
| ||||
Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського