Ключ. слова: мурамоилдипептид, арилгликозиды, гликозилирование, межфазный катализ
Індекс рубрикатора НБУВ: Г297.2-4

Рубрики:

Пептиди

Шифр НБУВ: Ж24793 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Ключ. слова: Гликопептиды, мурамоилдипептид, гликозиды мурамоилдипептида, оксазолиновый метод, фотобактерии, вирус гриппа
Індекс рубрикатора НБУВ: Г291.233 + Г297.2 + Л662.912.3 + Р281.7/9-29 + Р514.311-29

Рубрики:

Пептиди

Глікозиди

Окремі групи лікарських речовин, засобів і препаратів

Грип

Шифр НБУВ: Ж24793 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Складено обгрунтовану схему рівноваг процесу комплексоутворення у системі кобальт (ІІ) - дипептид (аланілаланін, аланілнорвалін, аланілнорлейцин, аланілвалін, аланіллейцин) у інертній атмосфері, що містить: реакції кислотної дисоціації молекули дипептиду, утворення моно- та бісдипептидних комплексів, кислотної дисоціації координованих аніонів дипептиду і утворення змішанолігандного комплексу з одним бі- та одним монозарядним аніоном дипептиду. За даними рН-метричних досліджень розраховано константи рівноваг усіх стадій процесу.

Составлена обоснованная схема равновесий процесса комплексообразования в системе кобальт(II) - дипептид (аланилаланин, аланилнорвалин, аланилнорлейцин, аланилвалин, аланиллейцин) в инертной атмосфере, включающая реакции: кислотной диссоциации молекулы дипептида, образования моно- и бисдипептидных комплексов, кислотной диссоциации координированных анионов дипептида и образования смешаннолигандного комплекса, с одним би- и одним монозарядным анионом дипептида. По данным рН-метрических исследований рассчитаны константы равновесия всех стадий процесса.

It has been drawn up a substantiated equilibrium scheme of complexation in the system cobalt (II) -dipeptides (alanylalanine, alanylnorvaline, alanylnorleucine, alanylvaline, alanylleucine) complexes in an inert atmosphere. The scheme includes such reactions as: acidic dissociation of dipeptide molecule, formation of mono- and bisdipeptide complexes of acidic dissociation of coordinated peptide anions and formation of the complex with one bi- and one mono -charged anion of dipeptide. According to thedata of pH-metric investigations the equilibrium constants of the all stages of process have been calculated.

Індекс рубрикатора НБУВ: Л71-3 + Г297.2-271.3

Рубрики:

Високомолекулярні сполуки (полімери) та пластмаси

Пептиди

Шифр НБУВ: Ж29143 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Получены Раман спектры политрипептида poly(Gly-Pro-Pro) и коллагена I типа в растворах оксида дейтерия. Частоты валентных карбонильных колебаний типа A рассчитаны согласно модели слабосвязанных осцилляторов, в рамках теории возмущений для полипептидных структур с учетом динамических резонансных взаимодействий диполей перехода. Рассчитанные частоты удовлетворительно согласуются с экспериментальными частотами полосы Амид I в Раман спектрах.

Індекс рубрикатора НБУВ: Г128.126-4 + Г297.2

Рубрики:

Комплексні сполуки кобальту

Пептиди

Шифр НБУВ: Ж21854 Пошук видання у каталогах НБУВ 

  Скачати повний текст

Вперше вивчено вплив міцелярних розчинів поверхнево-активних речовин (аніонного додецилсульфата натрію, катіонного цетилпіридиній хлориду та неіонногенного Брідж 35) на константи дисоціації вільних амінокислот (альфа-аланіну і валіну) та дипептидів, сформованих із них.

Кінетичні властивості згортання пептиду, що складається з семи амінокислот аланіне, досліджено за допомогою методу молекулярної динаміки. Пептид розглянуто, використовуючи два типи неявного опису розчинника: модель, в якій діелектрична константа вважається пропорційною до відстані між атомами, й узагальнена модель Борна. Знайдено, що обидві моделі розчинника ведуть до утворення спірального стану пептиду за низьких температур. Проте кінетичні властивості спірального переходу є різними для досліджених розчинників. Стверджено, що модель, в якій діелектрична константа вважається змінною, веде до утворення значного числа локальних мінімумів на поверхні потенціальної енергії, що в свою чергу сповільнює реакцію згортання. Показано, що характеристики узагальненої моделі Борна адекватно описують кінетичні властивості білків, спостережувані в експериментах по їх згортанню. На підставі одержаних результатів зроблено висновок, що узагальнена модель Борна є вдалішою та більш реалістичною моделлю для опису кінетики згортання білків.

Індекс рубрикатора НБУВ: Г215.6,0 + Г297.2-15

Рубрики:

Мас-спектроскопія органічних сполук

Пептиди

Шифр НБУВ: РА387195 Пошук видання у каталогах НБУВ 

Методами класичної пептидної хімії синтезовано серію метилових ефірів стереоізомерних дипептидів, що мають послідовність амінокислот Tyr-Arg і Arg-Tyr. Вивчення їх реакційної здатності відносно до тромбіну та трипсину показало, що кінетичні параметри гідролізу стереоізомерних сполук цими ферментами суттєво відрізняються. Випробування синтезованих пептидів на виявлення ними анальгетичного ефекту та інгібування реакції розщеплення фібриногену тромбіном, а також процесу полімеризації фібрин-мономера показало, що біологічна їх активність залежить від структури пептидів та конфігурації амінокислотних залишків, що входять до їх складу.

Розчинність та конформаційна стабільність протеїну є результатом балансу взаємодій як в межах протеїну, так і між протеїном і розчинником. Вільна енергія електростатичної сольватації олігогліцинів, моделей для хребта протеїну, стає більш вигідною зі зростанням довжини, до того ж довші пептиди колапсують через формування вигідних внутріпептидних взаємодій між диполями CO, в деяких випадках без водневих зв'язків. Сильно відштовхувальне формування розчинникової порожнини збалансовується ван дер вальсівським притяганням та електростатичними внесками. Для того, щоб дослідити конкуренцію між виключенням розчинника та зарядовими взаємодіями, змодельовано колапс довгого олігогліцину з 15-ма блоками за скейлінгу зарядів на пептиді від нуля до повного заряду. Вивчено, який ефект це має на конформаційні властивості пептиду. Описано приблизні термодинамічні зміни, що відбуваються під час скейлінгу як через інтрапептидні потенціали, так і через потенціали пептид-вода, і визначено вільну енергію електростатичної сольватації для системи.

Індекс рубрикатора НБУВ: Г252.736-15 + Г297.2-15

Рубрики:

Ароматичні амінокислоти та їх похідні

Пептиди

Шифр НБУВ: Ж28079/фіз.-мат. Пошук видання у каталогах НБУВ 

Визначено вплив виду розчинника на повноту осадження фосфопептидів із ферментативних гідролізатів протеїнів казеїнового комплексу молока корів. Як субстрат для отримання фосфопептидів використовували загальний казеїн, виділений із свіжого знежиреного молока подвійним переосадженням в ізоелектричній точці. Фосфопептиди з гідролізату виділяли селективним осадженням солями кальцію за наявності різних розчинників. Вихід біоактивних фосфопептидів досліджено при використанні етанолу, пропанолу, ізопропанолу, бутанолу. Гель-фільтрацією на сефадексі G-25 встановлено особливості молекулярно-масового розподілу осаджених різними спиртами казофосфопептидів. Виявлено, що при осадженні етанолом досягається найвищий вихід фосфопептидів (11,78 %), які за молекулярною масою подібні до відомих природних біоактивних фосфопептидів. Використання пропанолу та ізопропанолу призводить до втрати частини фосфопептидів великого і середнього розмірів.

Розглянуто синтез фторовмісних та конформаційно обмежених аналогів природних амінокислот та їх використання як міток для твердотільної {\up\fs8 19}F ЯМР спектроскопії. Розроблено дизайн, сплановано та проведено синтез першого фторовмісного похідного 2,4-метанопроліну. Розроблено дизайн, сплановано та проведено синтез двох ароматичних фторвмісних конформаційно обмежених амінокислот. Доведено сумісність одержаних аналогів фенілаланіну з типовими методиками пептидного синтезу та продемонстровано можливість застосування у твердотільній {\up\fs8 19}F ЯМР спектроскопії. Розроблено дизайн, сплановано та проведено синтез першої полярної {\up\fs8 19}F ЯМР мітки - аналога серину. Досліджено кислотно-основні властивості спиртової групи одержаного аналога серину та доведено його сумісність зі стандартними методиками пептидного синтезу. Продемонстровано можливість застосування цієї амінокислоти як мітки для дослідження мембраноактивних пептидів методом {\up\fs8 19}F ЯМР спектроскопії.

Проведено дизайн, синтез і дослідження як інгібіторів p53/MDM2 взаємодії шести нових "степлених" фотоконтрольованих пептидоміметиків - аналогів відомого інгібітора pDI. Фотоконтролю активності пептидоміметиків досягнуто завдяки введенню в їх молекули фрагмента діарилетену, здатного до фотоізомеризації. Встановлено, що з'єднання амінокислотних залишків у лінійному прекурсорі в положеннях i,i+7 діарилетеновмісним лінкером є оптимальним для отримання активних фотоконтрольованих інгібіторів. Константи інгібування протеїну MDM2 деяких отриманих пептидоміметиків сягали значень кількох наномолів, що ставить їх в один ряд із найбільш активними відомими на цей час інгібіторами p53/MDM2 взає модії. Перспективним є подальше дослідження отриманих сполук як засобів терапії захворювань на рак.