ІНСТИТУТ ІСТОРИЧНОЇ УРБАНІСТИКИ (2012–)
основні напрями роботи Інституту: історична урбаністика, усна історія, історична регіоналістика

 УКРАЇНСЬКИЙ ГІДРОМЕТЕОРОЛОГІЧНИЙ ЦЕНТР (2011–)
державна установа в складі Державної служби України з надзвичайних ситуацій, що провадить метеорологічні та гідрологічні спостереження на території України

 НАЦІОНАЛЬНА АКАДЕМІЯ ПРАВОВИХ НАУК УКРАЇНИ (2011–)
державна наукова організація, яка координує, організує і проводить фундаментальні та прикладні наукові дослідження у галузі держави і права

 ІНСТИТУТ ЕКОНОМІКИ ПРИРОДОКОРИСТУВАННЯ ТА СТАЛОГО РОЗВИТКУ (2010–)
наукова установа головні завдання котрої складають розробка фундаментальних і прикладних досліджень економіки природокористування, спрямованих на забезпечення економічного обґрунтування використання та охорони природних ресурсів і сталого розвитку України

 ІНСТИТУТ КУЛЬТУРОЛОГІЇ НАМУ (2007–)
установа, що здійснює фундаментальні і прикладні наукові дослідження у галузях теорії та історії культури, етнокультурології та культурної антропології, музеєзнавства, пам’яткознавства, прикладної культурології

 ЦЕНТР ДОСЛІДЖЕНЬ ІСТОРІЇ ТА КУЛЬТУРИ СХІДНОЄВРОПЕЙСЬКОГО ЄВРЕЙСТВА (2006–)
наукова та культурно-просвітницька установа в галузі юдаїки, що працює у структурі Національного університету "Києво-Могилянська академія"; місія Центру полягає в накопиченні, розвиткові та поширенні знань про минуле і сьогодення єврейства України та Центрально-Східної Європи

 УКРАЇНСЬКИЙ ІНСТИТУТ НАЦІОНАЛЬНОЇ ПАМ'ЯТІ (2006–)
центральний орган виконавчої влади у сфері відновлення та збереження національної пам'яті Українського народу, посилення уваги суспільства до історії України та здійснення заходів з увічнення пам'яті учасників національно-визвольної боротьби, жертв голодоморів та політичних репресій

 ІСТОРИКО-КУЛЬТУРНИЙ ЗАПОВІДНИК БІЛЬСЬК (2005–)
заповідник у селищі міського типу Котельва Полтавської області; до складу археологічної території входять більша частина Більського городища скіфського часу, а також пам'ятки його округи, розташовані у межах Полтавської області; північна частина городища і Куземинське укріплення розташовані у межах Сумської області

 ЦЕНТР МІСЬКОЇ ІСТОРІЇ ЦЕНТРАЛЬНО-СХІДНОЇ ЄВРОПИ (2004–)
незалежний науково-дослідний центр історії міст Центрально-Східної Європи

 ІНСТИТУТ ЕНЦИКЛОПЕДИЧНИХ ДОСЛІДЖЕНЬ (2004–)
науково-дослідний інститут НАН України; головним завданням Інституту є здійснення фундаментальних, пошукових і прикладних досліджень в галузі енциклопедознавства для одержання нових наукових знань, сприяння науково-технічному прогресові, соціально-економічному та духовному розвитку суспільства, утвердження української державності

 ІНСТИТУТ ЕВОЛЮЦІЙНОЇ ЕКОЛОГІЇ (2004–)
наукова установа екологічного профілю; здійснює розробку наукових основ і практичних заходів щодо охорони, збереження та відновлення біорізноманіття, зокрема різноманіття рослинних угруповань та фауністичних комплексів в межах мегаполісу на прикладі м. Києва

 ІНСТИТУТ ДЕМОГРАФІЇ ТА СОЦІАЛЬНИХ ДОСЛІДЖЕНЬ ІМЕНІ М. В. ПТУХИ (2002–)
науково-дослідна установа, яка спеціалізується на системних дослідженнях проблем демографічного і соціального розвитку, проводить фундаментальні та прикладні дослідження, моделює новітні тенденції, розробляє комплексні демографічні прогнози та концептуальні засади державної соціально-демографічної політики

 ІНСТИТУТ ПРОБЛЕМ СУЧАСНОГО МИСТЕЦТВА (2001–)
єдина науково-дослідна установа в Україні, яка здійснює фундаментальні наукові дослідження у галузі всіх видів сучасного мистецтва, практичні і пошукові студії, спрямовані на розвиток професійного сучасного мистецтва й архітектури

 НАЦІОНАЛЬНИЙ НАУКОВО-ДОСЛІДНИЙ ІНСТИТУТ УКРАЇНОЗНАВСТВА (2000–)
наукова інституція України, до компетенції якої належить розробка наукової концепції українознавства, впровадження його здобутків в освітню практику, а також координація українознавчих наукових студій в усіх країнах розселення українців

 НАУКОВО-ДОСЛІДНИЙ ІНСТИТУТ ДЕРЖАВНОГО БУДІВНИЦТВА ТА МІСЦЕВОГО САМОВРЯДУВАННЯ (2000–)
провідна наукова установа України, що спеціалізується на дослідженні юридичних аспектів комплексної проблематики процесів розбудови державності

 ІНСТИТУТ КЕРАМОЛОГІЇ–ВІДДІЛЕННЯ ІНСТИТУТУ НАРОДОЗНАВСТВА (2000–)
науково-дослідний інститут в системі Національної академії наук України, відділення Інституту народознавства, розташований в м. Опішня Полтавської області

 УКРАЇНСЬКИЙ ІНСТИТУТ ВИВЧЕННЯ ГОЛОКОСТУ ТКУМА (1999–)
перший національний центр з вивчення історії Голокосту

 КРИМСЬКИЙ НАУКОВИЙ ЦЕНТР (1997–2015)
установа покликана координувати діяльність вищих навчальних закладів та науково-дослідних установ при розробленні проблем, які мають важливе значення для соціально-економічного і культурного розвитку Криму

 НАЦІОНАЛЬНА АКАДЕМІЯ МИСТЕЦТВ УКРАЇНИ (1996–)
творчо-наукова установа в галузі художньої культури

 НАУКОВО-ДОСЛІДНИЙ ІНСТИТУТ КОЗАЦТВА (1996–)
центр з вивчення історії козацтва в Україні та інших країнах